Protein–RNA interactions for Protein: P48058

GRIA4, Glutamate receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA4P48058 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GRIA4P48058 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GRIA4P48058 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GRIA4P48058 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GRIA4P48058 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GRIA4P48058 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GRIA4P48058 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GRIA4P48058 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GRIA4P48058 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GRIA4P48058 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GRIA4P48058 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GRIA4P48058 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GRIA4P48058 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GRIA4P48058 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GRIA4P48058 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GRIA4P48058 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GRIA4P48058 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GRIA4P48058 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GRIA4P48058 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GRIA4P48058 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GRIA4P48058 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GRIA4P48058 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GRIA4P48058 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GRIA4P48058 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GRIA4P48058 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GRIA4P48058 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GRIA4P48058 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GRIA4P48058 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GRIA4P48058 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GRIA4P48058 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GRIA4P48058 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GRIA4P48058 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GRIA4P48058 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GRIA4P48058 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GRIA4P48058 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GRIA4P48058 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GRIA4P48058 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GRIA4P48058 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GRIA4P48058 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GRIA4P48058 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GRIA4P48058 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GRIA4P48058 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GRIA4P48058 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GRIA4P48058 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GRIA4P48058 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GRIA4P48058 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GRIA4P48058 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GRIA4P48058 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GRIA4P48058 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GRIA4P48058 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GRIA4P48058 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GRIA4P48058 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GRIA4P48058 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GRIA4P48058 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GRIA4P48058 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GRIA4P48058 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GRIA4P48058 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GRIA4P48058 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GRIA4P48058 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GRIA4P48058 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GRIA4P48058 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GRIA4P48058 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GRIA4P48058 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GRIA4P48058 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GRIA4P48058 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GRIA4P48058 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GRIA4P48058 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GRIA4P48058 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GRIA4P48058 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GRIA4P48058 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GRIA4P48058 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GRIA4P48058 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GRIA4P48058 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GRIA4P48058 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GRIA4P48058 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GRIA4P48058 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GRIA4P48058 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GRIA4P48058 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GRIA4P48058 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GRIA4P48058 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GRIA4P48058 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GRIA4P48058 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GRIA4P48058 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GRIA4P48058 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GRIA4P48058 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GRIA4P48058 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GRIA4P48058 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GRIA4P48058 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GRIA4P48058 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GRIA4P48058 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GRIA4P48058 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GRIA4P48058 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GRIA4P48058 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GRIA4P48058 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GRIA4P48058 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GRIA4P48058 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GRIA4P48058 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GRIA4P48058 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GRIA4P48058 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GRIA4P48058 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.1 ms