Protein–RNA interactions for Protein: P43268

ETV4, ETS translocation variant 4, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETV4P43268 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ETV4P43268 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ETV4P43268 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ETV4P43268 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ETV4P43268 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ETV4P43268 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ETV4P43268 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ETV4P43268 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ETV4P43268 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ETV4P43268 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ETV4P43268 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ETV4P43268 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ETV4P43268 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ETV4P43268 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ETV4P43268 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ETV4P43268 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ETV4P43268 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ETV4P43268 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ETV4P43268 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ETV4P43268 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ETV4P43268 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ETV4P43268 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ETV4P43268 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ETV4P43268 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ETV4P43268 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ETV4P43268 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ETV4P43268 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ETV4P43268 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ETV4P43268 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ETV4P43268 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ETV4P43268 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ETV4P43268 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ETV4P43268 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ETV4P43268 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ETV4P43268 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ETV4P43268 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ETV4P43268 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ETV4P43268 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ETV4P43268 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ETV4P43268 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ETV4P43268 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ETV4P43268 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ETV4P43268 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ETV4P43268 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ETV4P43268 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ETV4P43268 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ETV4P43268 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ETV4P43268 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ETV4P43268 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ETV4P43268 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ETV4P43268 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ETV4P43268 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ETV4P43268 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ETV4P43268 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ETV4P43268 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ETV4P43268 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ETV4P43268 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ETV4P43268 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ETV4P43268 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ETV4P43268 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ETV4P43268 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ETV4P43268 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ETV4P43268 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ETV4P43268 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ETV4P43268 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ETV4P43268 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ETV4P43268 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ETV4P43268 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ETV4P43268 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ETV4P43268 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ETV4P43268 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ETV4P43268 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ETV4P43268 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ETV4P43268 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ETV4P43268 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ETV4P43268 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ETV4P43268 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ETV4P43268 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ETV4P43268 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ETV4P43268 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ETV4P43268 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ETV4P43268 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ETV4P43268 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ETV4P43268 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ETV4P43268 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ETV4P43268 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ETV4P43268 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ETV4P43268 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ETV4P43268 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ETV4P43268 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ETV4P43268 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ETV4P43268 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ETV4P43268 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ETV4P43268 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ETV4P43268 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ETV4P43268 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ETV4P43268 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ETV4P43268 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ETV4P43268 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ETV4P43268 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms