Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

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Length 343 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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HOXD13P35453 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXD13P35453 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXD13P35453 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXD13P35453 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXD13P35453 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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HOXD13P35453 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXD13P35453 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXD13P35453 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXD13P35453 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXD13P35453 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
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HOXD13P35453 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXD13P35453 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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HOXD13P35453 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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HOXD13P35453 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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HOXD13P35453 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXD13P35453 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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HOXD13P35453 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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HOXD13P35453 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXD13P35453 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXD13P35453 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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HOXD13P35453 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
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HOXD13P35453 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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HOXD13P35453 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXD13P35453 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXD13P35453 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
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HOXD13P35453 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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HOXD13P35453 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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HOXD13P35453 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXD13P35453 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXD13P35453 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXD13P35453 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXD13P35453 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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