Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CASP1P29466 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CASP1P29466 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CASP1P29466 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CASP1P29466 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CASP1P29466 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CASP1P29466 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CASP1P29466 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CASP1P29466 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CASP1P29466 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CASP1P29466 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CASP1P29466 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CASP1P29466 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CASP1P29466 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CASP1P29466 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CASP1P29466 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CASP1P29466 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CASP1P29466 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CASP1P29466 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CASP1P29466 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CASP1P29466 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CASP1P29466 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CASP1P29466 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CASP1P29466 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CASP1P29466 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CASP1P29466 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CASP1P29466 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CASP1P29466 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CASP1P29466 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CASP1P29466 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CASP1P29466 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CASP1P29466 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CASP1P29466 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CASP1P29466 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CASP1P29466 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CASP1P29466 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CASP1P29466 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CASP1P29466 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CASP1P29466 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CASP1P29466 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CASP1P29466 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CASP1P29466 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CASP1P29466 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CASP1P29466 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASP1P29466 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASP1P29466 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASP1P29466 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CASP1P29466 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASP1P29466 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASP1P29466 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASP1P29466 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASP1P29466 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASP1P29466 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASP1P29466 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASP1P29466 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASP1P29466 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASP1P29466 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASP1P29466 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASP1P29466 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASP1P29466 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASP1P29466 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASP1P29466 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASP1P29466 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASP1P29466 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASP1P29466 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASP1P29466 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASP1P29466 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASP1P29466 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CASP1P29466 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASP1P29466 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASP1P29466 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASP1P29466 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CASP1P29466 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASP1P29466 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CASP1P29466 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASP1P29466 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASP1P29466 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASP1P29466 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASP1P29466 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASP1P29466 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASP1P29466 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASP1P29466 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASP1P29466 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASP1P29466 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASP1P29466 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASP1P29466 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASP1P29466 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASP1P29466 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASP1P29466 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASP1P29466 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASP1P29466 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASP1P29466 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASP1P29466 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASP1P29466 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASP1P29466 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CASP1P29466 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASP1P29466 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASP1P29466 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASP1P29466 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASP1P29466 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66 ms