Protein–RNA interactions for Protein: P28074

PSMB5, Proteasome subunit beta type-5, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB5P28074 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PSMB5P28074 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PSMB5P28074 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PSMB5P28074 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PSMB5P28074 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
PSMB5P28074 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PSMB5P28074 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PSMB5P28074 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PSMB5P28074 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PSMB5P28074 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PSMB5P28074 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PSMB5P28074 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PSMB5P28074 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PSMB5P28074 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PSMB5P28074 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PSMB5P28074 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PSMB5P28074 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PSMB5P28074 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
PSMB5P28074 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PSMB5P28074 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PSMB5P28074 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PSMB5P28074 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PSMB5P28074 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PSMB5P28074 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PSMB5P28074 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
PSMB5P28074 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
PSMB5P28074 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PSMB5P28074 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PSMB5P28074 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PSMB5P28074 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PSMB5P28074 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PSMB5P28074 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PSMB5P28074 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
PSMB5P28074 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
PSMB5P28074 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
PSMB5P28074 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
PSMB5P28074 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
PSMB5P28074 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
PSMB5P28074 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
PSMB5P28074 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PSMB5P28074 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PSMB5P28074 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PSMB5P28074 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PSMB5P28074 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PSMB5P28074 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PSMB5P28074 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PSMB5P28074 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PSMB5P28074 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PSMB5P28074 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PSMB5P28074 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PSMB5P28074 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PSMB5P28074 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PSMB5P28074 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PSMB5P28074 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PSMB5P28074 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PSMB5P28074 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PSMB5P28074 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PSMB5P28074 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PSMB5P28074 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
PSMB5P28074 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PSMB5P28074 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PSMB5P28074 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PSMB5P28074 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PSMB5P28074 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PSMB5P28074 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PSMB5P28074 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PSMB5P28074 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PSMB5P28074 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PSMB5P28074 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PSMB5P28074 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PSMB5P28074 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PSMB5P28074 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
PSMB5P28074 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PSMB5P28074 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PSMB5P28074 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
PSMB5P28074 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PSMB5P28074 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PSMB5P28074 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PSMB5P28074 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PSMB5P28074 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PSMB5P28074 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PSMB5P28074 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PSMB5P28074 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PSMB5P28074 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PSMB5P28074 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PSMB5P28074 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PSMB5P28074 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PSMB5P28074 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PSMB5P28074 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PSMB5P28074 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PSMB5P28074 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PSMB5P28074 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PSMB5P28074 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PSMB5P28074 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PSMB5P28074 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PSMB5P28074 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PSMB5P28074 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PSMB5P28074 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PSMB5P28074 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PSMB5P28074 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.6 ms