Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 SH3TC2-202ENST00000502274 2681 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC13.52□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 MAGI2-218ENST00000630991 2349 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 TBC1D9B-208ENST00000519746 2755 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.7 ms