Protein–RNA interactions for Protein: P25963

NFKBIA, NF-kappa-B inhibitor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIAP25963 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NFKBIAP25963 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NFKBIAP25963 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NFKBIAP25963 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NFKBIAP25963 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NFKBIAP25963 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NFKBIAP25963 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NFKBIAP25963 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NFKBIAP25963 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NFKBIAP25963 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NFKBIAP25963 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NFKBIAP25963 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NFKBIAP25963 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NFKBIAP25963 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NFKBIAP25963 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NFKBIAP25963 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NFKBIAP25963 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NFKBIAP25963 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NFKBIAP25963 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NFKBIAP25963 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NFKBIAP25963 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NFKBIAP25963 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NFKBIAP25963 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NFKBIAP25963 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NFKBIAP25963 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
NFKBIAP25963 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NFKBIAP25963 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
NFKBIAP25963 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NFKBIAP25963 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NFKBIAP25963 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms