Protein–RNA interactions for Protein: P25788

PSMA3, Proteasome subunit alpha type-3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA3P25788 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms