Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRHP20396 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRHP20396 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRHP20396 MC5R-201ENST00000324750 1319 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRHP20396 MED7-202ENST00000420343 1382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRHP20396 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRHP20396 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRHP20396 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRHP20396 CSHL1-201ENST00000259003 739 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRHP20396 ATP5J-204ENST00000400093 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRHP20396 KCNK15-AS1-202ENST00000427303 528 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRHP20396 CSHL1-206ENST00000450719 973 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRHP20396 LINC02063-201ENST00000503415 566 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRHP20396 AC092862.1-201ENST00000541534 533 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TRHP20396 USP3-AS1-204ENST00000559861 620 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRHP20396 AC090825.1-202ENST00000560059 665 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRHP20396 EEF1DP7-201ENST00000580496 513 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TRHP20396 MIR4254-201ENST00000581063 76 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TRHP20396 AC017033.1-201ENST00000603720 708 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRHP20396 NEK4P3-201ENST00000604859 544 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TRHP20396 AL118522.1-201ENST00000611368 560 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TRHP20396 AC006986.1-201ENST00000612764 241 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TRHP20396 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRHP20396 RBFOX3-203ENST00000580155 1519 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRHP20396 SUCLA2-205ENST00000470760 1445 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRHP20396 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRHP20396 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRHP20396 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRHP20396 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRHP20396 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRHP20396 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRHP20396 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRHP20396 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRHP20396 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRHP20396 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRHP20396 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRHP20396 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRHP20396 RGR-203ENST00000372092 868 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRHP20396 AC003659.1-201ENST00000424251 465 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRHP20396 SOD2-205ENST00000444946 917 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRHP20396 RN7SL173P-201ENST00000461853 292 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TRHP20396 RN7SL23P-201ENST00000484055 275 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TRHP20396 RN7SL288P-201ENST00000490496 291 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TRHP20396 TRPC7-AS1-201ENST00000514459 460 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRHP20396 AP000920.1-201ENST00000531824 344 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TRHP20396 AP003390.1-201ENST00000533253 523 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRHP20396 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRHP20396 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRHP20396 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRHP20396 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TRHP20396 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRHP20396 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRHP20396 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRHP20396 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRHP20396 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRHP20396 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRHP20396 NNMT-203ENST00000535401 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRHP20396 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRHP20396 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TRHP20396 LAIR1-209ENST00000434277 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRHP20396 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRHP20396 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRHP20396 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRHP20396 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRHP20396 PPHLN1-223ENST00000610488 1521 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRHP20396 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TRHP20396 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRHP20396 TMEM60-201ENST00000257663 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRHP20396 ZNRD1-204ENST00000376785 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRHP20396 PRKCZ-AS1-202ENST00000444529 622 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRHP20396 LRRC75A-AS1-213ENST00000484836 821 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRHP20396 IMMP1L-202ENST00000526776 469 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRHP20396 NAT9-219ENST00000582524 573 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRHP20396 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRHP20396 AC004223.2-201ENST00000590309 544 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TRHP20396 AC025048.2-201ENST00000590744 786 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRHP20396 AC007250.1-201ENST00000608934 338 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TRHP20396 CHD2-218ENST00000629346 1249 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRHP20396 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRHP20396 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRHP20396 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRHP20396 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRHP20396 ERCC1-208ENST00000589165 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRHP20396 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRHP20396 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRHP20396 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TRHP20396 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRHP20396 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRHP20396 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRHP20396 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRHP20396 RBFOX1-214ENST00000552089 1430 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRHP20396 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRHP20396 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRHP20396 DCAF7-201ENST00000415273 1220 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRHP20396 LINC02171-201ENST00000508619 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRHP20396 LINC02281-201ENST00000549013 375 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRHP20396 AC073896.4-201ENST00000553176 403 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRHP20396 AC060766.1-201ENST00000590824 627 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TRHP20396 MIEF1-215ENST00000637854 213 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TRHP20396 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
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