Protein–RNA interactions for Protein: P18428

LBP, Lipopolysaccharide-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LBPP18428 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LBPP18428 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LBPP18428 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LBPP18428 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LBPP18428 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LBPP18428 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC15.07■□□□□ 0
LBPP18428 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LBPP18428 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LBPP18428 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LBPP18428 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LBPP18428 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LBPP18428 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LBPP18428 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LBPP18428 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LBPP18428 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LBPP18428 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LBPP18428 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LBPP18428 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
LBPP18428 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LBPP18428 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LBPP18428 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LBPP18428 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LBPP18428 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LBPP18428 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LBPP18428 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LBPP18428 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
LBPP18428 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
LBPP18428 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
LBPP18428 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC15.06■□□□□ 0
LBPP18428 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC15.06■□□□□ 0
LBPP18428 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
LBPP18428 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LBPP18428 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LBPP18428 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
LBPP18428 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LBPP18428 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC15.06■□□□□ 0
LBPP18428 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LBPP18428 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LBPP18428 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LBPP18428 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LBPP18428 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LBPP18428 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC15.06■□□□□ 0
LBPP18428 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LBPP18428 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LBPP18428 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LBPP18428 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LBPP18428 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LBPP18428 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LBPP18428 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LBPP18428 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LBPP18428 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LBPP18428 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LBPP18428 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LBPP18428 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LBPP18428 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LBPP18428 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LBPP18428 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LBPP18428 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LBPP18428 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LBPP18428 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LBPP18428 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LBPP18428 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
LBPP18428 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.05■□□□□ 0
LBPP18428 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LBPP18428 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LBPP18428 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
LBPP18428 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LBPP18428 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
LBPP18428 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LBPP18428 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LBPP18428 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LBPP18428 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LBPP18428 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LBPP18428 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LBPP18428 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LBPP18428 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LBPP18428 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LBPP18428 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LBPP18428 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LBPP18428 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LBPP18428 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LBPP18428 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC15.05■□□□□ -0
LBPP18428 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.05■□□□□ -0
LBPP18428 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LBPP18428 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC15.05■□□□□ -0
LBPP18428 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LBPP18428 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
LBPP18428 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LBPP18428 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LBPP18428 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
LBPP18428 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LBPP18428 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LBPP18428 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LBPP18428 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LBPP18428 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.05■□□□□ -0
LBPP18428 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LBPP18428 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
LBPP18428 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LBPP18428 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LBPP18428 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms