Protein–RNA interactions for Protein: P17861

XBP1, X-box-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XBP1P17861 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
XBP1P17861 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
XBP1P17861 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
XBP1P17861 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
XBP1P17861 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
XBP1P17861 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
XBP1P17861 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
XBP1P17861 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
XBP1P17861 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
XBP1P17861 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
XBP1P17861 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
XBP1P17861 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
XBP1P17861 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
XBP1P17861 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
XBP1P17861 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
XBP1P17861 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
XBP1P17861 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
XBP1P17861 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
XBP1P17861 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
XBP1P17861 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
XBP1P17861 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
XBP1P17861 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
XBP1P17861 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
XBP1P17861 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
XBP1P17861 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
XBP1P17861 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
XBP1P17861 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
XBP1P17861 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
XBP1P17861 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
XBP1P17861 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
XBP1P17861 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
XBP1P17861 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
XBP1P17861 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
XBP1P17861 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
XBP1P17861 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
XBP1P17861 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
XBP1P17861 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
XBP1P17861 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
XBP1P17861 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
XBP1P17861 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
XBP1P17861 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
XBP1P17861 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
XBP1P17861 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
XBP1P17861 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
XBP1P17861 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
XBP1P17861 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
XBP1P17861 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
XBP1P17861 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
XBP1P17861 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
XBP1P17861 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
XBP1P17861 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
XBP1P17861 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
XBP1P17861 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
XBP1P17861 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
XBP1P17861 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
XBP1P17861 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
XBP1P17861 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
XBP1P17861 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
XBP1P17861 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
XBP1P17861 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
XBP1P17861 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
XBP1P17861 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
XBP1P17861 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
XBP1P17861 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
XBP1P17861 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
XBP1P17861 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
XBP1P17861 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
XBP1P17861 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
XBP1P17861 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
XBP1P17861 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
XBP1P17861 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
XBP1P17861 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
XBP1P17861 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
XBP1P17861 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
XBP1P17861 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
XBP1P17861 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
XBP1P17861 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
XBP1P17861 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
XBP1P17861 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
XBP1P17861 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
XBP1P17861 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
XBP1P17861 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
XBP1P17861 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
XBP1P17861 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
XBP1P17861 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
XBP1P17861 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
XBP1P17861 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
XBP1P17861 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
XBP1P17861 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
XBP1P17861 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
XBP1P17861 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
XBP1P17861 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
XBP1P17861 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
XBP1P17861 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
XBP1P17861 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
XBP1P17861 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
XBP1P17861 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
XBP1P17861 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
XBP1P17861 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
XBP1P17861 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108 ms