Protein–RNA interactions for Protein: P05546

SERPIND1, Heparin cofactor 2, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPIND1P05546 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SERPIND1P05546 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SERPIND1P05546 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SERPIND1P05546 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SERPIND1P05546 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SERPIND1P05546 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SERPIND1P05546 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SERPIND1P05546 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SERPIND1P05546 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SERPIND1P05546 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SERPIND1P05546 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SERPIND1P05546 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SERPIND1P05546 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SERPIND1P05546 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SERPIND1P05546 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SERPIND1P05546 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SERPIND1P05546 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SERPIND1P05546 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SERPIND1P05546 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SERPIND1P05546 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SERPIND1P05546 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SERPIND1P05546 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SERPIND1P05546 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SERPIND1P05546 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SERPIND1P05546 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SERPIND1P05546 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
SERPIND1P05546 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SERPIND1P05546 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SERPIND1P05546 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SERPIND1P05546 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SERPIND1P05546 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SERPIND1P05546 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SERPIND1P05546 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SERPIND1P05546 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SERPIND1P05546 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SERPIND1P05546 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SERPIND1P05546 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SERPIND1P05546 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SERPIND1P05546 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SERPIND1P05546 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SERPIND1P05546 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SERPIND1P05546 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SERPIND1P05546 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SERPIND1P05546 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SERPIND1P05546 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SERPIND1P05546 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SERPIND1P05546 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SERPIND1P05546 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SERPIND1P05546 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SERPIND1P05546 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SERPIND1P05546 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SERPIND1P05546 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SERPIND1P05546 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SERPIND1P05546 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SERPIND1P05546 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SERPIND1P05546 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SERPIND1P05546 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SERPIND1P05546 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SERPIND1P05546 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SERPIND1P05546 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SERPIND1P05546 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SERPIND1P05546 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SERPIND1P05546 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SERPIND1P05546 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SERPIND1P05546 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SERPIND1P05546 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SERPIND1P05546 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SERPIND1P05546 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SERPIND1P05546 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SERPIND1P05546 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SERPIND1P05546 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SERPIND1P05546 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SERPIND1P05546 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SERPIND1P05546 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SERPIND1P05546 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SERPIND1P05546 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SERPIND1P05546 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SERPIND1P05546 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SERPIND1P05546 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SERPIND1P05546 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
SERPIND1P05546 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SERPIND1P05546 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SERPIND1P05546 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
SERPIND1P05546 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SERPIND1P05546 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
SERPIND1P05546 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SERPIND1P05546 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SERPIND1P05546 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SERPIND1P05546 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SERPIND1P05546 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SERPIND1P05546 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SERPIND1P05546 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SERPIND1P05546 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SERPIND1P05546 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SERPIND1P05546 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SERPIND1P05546 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SERPIND1P05546 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SERPIND1P05546 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SERPIND1P05546 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SERPIND1P05546 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.5 ms