Protein–RNA interactions for Protein: P01574

IFNB1, Interferon beta, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNB1P01574 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
IFNB1P01574 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IFNB1P01574 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IFNB1P01574 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IFNB1P01574 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IFNB1P01574 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
IFNB1P01574 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IFNB1P01574 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IFNB1P01574 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IFNB1P01574 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IFNB1P01574 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IFNB1P01574 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IFNB1P01574 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IFNB1P01574 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IFNB1P01574 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IFNB1P01574 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IFNB1P01574 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IFNB1P01574 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IFNB1P01574 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IFNB1P01574 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IFNB1P01574 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IFNB1P01574 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IFNB1P01574 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IFNB1P01574 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IFNB1P01574 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IFNB1P01574 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IFNB1P01574 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IFNB1P01574 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IFNB1P01574 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IFNB1P01574 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IFNB1P01574 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IFNB1P01574 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IFNB1P01574 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
IFNB1P01574 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IFNB1P01574 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IFNB1P01574 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IFNB1P01574 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IFNB1P01574 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IFNB1P01574 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IFNB1P01574 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IFNB1P01574 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IFNB1P01574 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IFNB1P01574 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IFNB1P01574 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IFNB1P01574 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IFNB1P01574 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IFNB1P01574 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IFNB1P01574 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IFNB1P01574 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IFNB1P01574 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IFNB1P01574 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IFNB1P01574 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IFNB1P01574 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IFNB1P01574 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
IFNB1P01574 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IFNB1P01574 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IFNB1P01574 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IFNB1P01574 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IFNB1P01574 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IFNB1P01574 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IFNB1P01574 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IFNB1P01574 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IFNB1P01574 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IFNB1P01574 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IFNB1P01574 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IFNB1P01574 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IFNB1P01574 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IFNB1P01574 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IFNB1P01574 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IFNB1P01574 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IFNB1P01574 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IFNB1P01574 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IFNB1P01574 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IFNB1P01574 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IFNB1P01574 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IFNB1P01574 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
IFNB1P01574 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms