Protein–RNA interactions for Protein: P00740

F9, Coagulation factor IX, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F9P00740 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
F9P00740 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
F9P00740 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
F9P00740 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
F9P00740 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
F9P00740 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
F9P00740 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
F9P00740 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
F9P00740 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
F9P00740 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
F9P00740 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
F9P00740 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
F9P00740 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
F9P00740 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
F9P00740 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
F9P00740 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
F9P00740 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
F9P00740 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
F9P00740 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
F9P00740 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
F9P00740 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
F9P00740 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
F9P00740 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
F9P00740 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
F9P00740 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
F9P00740 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
F9P00740 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
F9P00740 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
F9P00740 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
F9P00740 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
F9P00740 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
F9P00740 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
F9P00740 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
F9P00740 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
F9P00740 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
F9P00740 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
F9P00740 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
F9P00740 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
F9P00740 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
F9P00740 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
F9P00740 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
F9P00740 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
F9P00740 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
F9P00740 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
F9P00740 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
F9P00740 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
F9P00740 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
F9P00740 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
F9P00740 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
F9P00740 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
F9P00740 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
F9P00740 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
F9P00740 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
F9P00740 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
F9P00740 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
F9P00740 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
F9P00740 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
F9P00740 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
F9P00740 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
F9P00740 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
F9P00740 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
F9P00740 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
F9P00740 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
F9P00740 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
F9P00740 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
F9P00740 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
F9P00740 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
F9P00740 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
F9P00740 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
F9P00740 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
F9P00740 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
F9P00740 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
F9P00740 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
F9P00740 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
F9P00740 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
F9P00740 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
F9P00740 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
F9P00740 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
F9P00740 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
F9P00740 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
F9P00740 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
F9P00740 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
F9P00740 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
F9P00740 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
F9P00740 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
F9P00740 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
F9P00740 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
F9P00740 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
F9P00740 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
F9P00740 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
F9P00740 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
F9P00740 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
F9P00740 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
F9P00740 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
F9P00740 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
F9P00740 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
F9P00740 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
F9P00740 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
F9P00740 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
F9P00740 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms