Protein–RNA interactions for Protein: O00574

CXCR6, C-X-C chemokine receptor type 6, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCR6O00574 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CXCR6O00574 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CXCR6O00574 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CXCR6O00574 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CXCR6O00574 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CXCR6O00574 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CXCR6O00574 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CXCR6O00574 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CXCR6O00574 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CXCR6O00574 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CXCR6O00574 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CXCR6O00574 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CXCR6O00574 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CXCR6O00574 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CXCR6O00574 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CXCR6O00574 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CXCR6O00574 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CXCR6O00574 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CXCR6O00574 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CXCR6O00574 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CXCR6O00574 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CXCR6O00574 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CXCR6O00574 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CXCR6O00574 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CXCR6O00574 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CXCR6O00574 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CXCR6O00574 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CXCR6O00574 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CXCR6O00574 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CXCR6O00574 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CXCR6O00574 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CXCR6O00574 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CXCR6O00574 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CXCR6O00574 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CXCR6O00574 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CXCR6O00574 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CXCR6O00574 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CXCR6O00574 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CXCR6O00574 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CXCR6O00574 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CXCR6O00574 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CXCR6O00574 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CXCR6O00574 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CXCR6O00574 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CXCR6O00574 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CXCR6O00574 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CXCR6O00574 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CXCR6O00574 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CXCR6O00574 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CXCR6O00574 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CXCR6O00574 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CXCR6O00574 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CXCR6O00574 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CXCR6O00574 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CXCR6O00574 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CXCR6O00574 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CXCR6O00574 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CXCR6O00574 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CXCR6O00574 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CXCR6O00574 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CXCR6O00574 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CXCR6O00574 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CXCR6O00574 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CXCR6O00574 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CXCR6O00574 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CXCR6O00574 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CXCR6O00574 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CXCR6O00574 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CXCR6O00574 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CXCR6O00574 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CXCR6O00574 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CXCR6O00574 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CXCR6O00574 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CXCR6O00574 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CXCR6O00574 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CXCR6O00574 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CXCR6O00574 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CXCR6O00574 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CXCR6O00574 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CXCR6O00574 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CXCR6O00574 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CXCR6O00574 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CXCR6O00574 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CXCR6O00574 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CXCR6O00574 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CXCR6O00574 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CXCR6O00574 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CXCR6O00574 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CXCR6O00574 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CXCR6O00574 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CXCR6O00574 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CXCR6O00574 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CXCR6O00574 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CXCR6O00574 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CXCR6O00574 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CXCR6O00574 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CXCR6O00574 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CXCR6O00574 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CXCR6O00574 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CXCR6O00574 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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