Protein–RNA interactions for Protein: C9JH25

PRRT4, Proline-rich transmembrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 899 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT4C9JH25 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms