Protein–RNA interactions for Protein: A6NGN4

PRAMEF25, PRAME family member 25, humanhuman

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF25A6NGN4 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRAMEF25A6NGN4 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRAMEF25A6NGN4 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRAMEF25A6NGN4 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRAMEF25A6NGN4 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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