Protein–RNA interactions for Protein: A6NFT4

CFAP73, Cilia- and flagella-associated protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP73A6NFT4 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CFAP73A6NFT4 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CFAP73A6NFT4 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CFAP73A6NFT4 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CFAP73A6NFT4 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CFAP73A6NFT4 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CFAP73A6NFT4 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CFAP73A6NFT4 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CFAP73A6NFT4 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CFAP73A6NFT4 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CFAP73A6NFT4 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CFAP73A6NFT4 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CFAP73A6NFT4 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CFAP73A6NFT4 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CFAP73A6NFT4 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CFAP73A6NFT4 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CFAP73A6NFT4 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CFAP73A6NFT4 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CFAP73A6NFT4 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CFAP73A6NFT4 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CFAP73A6NFT4 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CFAP73A6NFT4 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CFAP73A6NFT4 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CFAP73A6NFT4 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CFAP73A6NFT4 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CFAP73A6NFT4 MFSD11-217ENST00000590514 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CFAP73A6NFT4 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CFAP73A6NFT4 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CFAP73A6NFT4 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CFAP73A6NFT4 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CFAP73A6NFT4 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CFAP73A6NFT4 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CFAP73A6NFT4 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CFAP73A6NFT4 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CFAP73A6NFT4 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CFAP73A6NFT4 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CFAP73A6NFT4 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CFAP73A6NFT4 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CFAP73A6NFT4 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CFAP73A6NFT4 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CFAP73A6NFT4 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CFAP73A6NFT4 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CFAP73A6NFT4 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CFAP73A6NFT4 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CFAP73A6NFT4 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CFAP73A6NFT4 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CFAP73A6NFT4 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CFAP73A6NFT4 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CFAP73A6NFT4 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CFAP73A6NFT4 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CFAP73A6NFT4 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CFAP73A6NFT4 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CFAP73A6NFT4 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CFAP73A6NFT4 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CFAP73A6NFT4 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CFAP73A6NFT4 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CFAP73A6NFT4 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CFAP73A6NFT4 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CFAP73A6NFT4 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CFAP73A6NFT4 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CFAP73A6NFT4 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CFAP73A6NFT4 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CFAP73A6NFT4 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CFAP73A6NFT4 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CFAP73A6NFT4 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CFAP73A6NFT4 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CFAP73A6NFT4 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CFAP73A6NFT4 CPA5-205ENST00000466363 2099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CFAP73A6NFT4 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFAP73A6NFT4 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFAP73A6NFT4 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFAP73A6NFT4 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFAP73A6NFT4 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFAP73A6NFT4 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFAP73A6NFT4 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFAP73A6NFT4 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFAP73A6NFT4 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFAP73A6NFT4 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFAP73A6NFT4 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFAP73A6NFT4 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFAP73A6NFT4 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFAP73A6NFT4 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFAP73A6NFT4 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CFAP73A6NFT4 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CFAP73A6NFT4 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFAP73A6NFT4 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFAP73A6NFT4 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CFAP73A6NFT4 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFAP73A6NFT4 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFAP73A6NFT4 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFAP73A6NFT4 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFAP73A6NFT4 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFAP73A6NFT4 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFAP73A6NFT4 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFAP73A6NFT4 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFAP73A6NFT4 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFAP73A6NFT4 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFAP73A6NFT4 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFAP73A6NFT4 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFAP73A6NFT4 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms