Protein–RNA interactions for Protein: A2RU54

HMX2, Homeobox protein HMX2, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMX2A2RU54 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms