Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNG2

TNFSF18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF18Q9UNG2 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
TNFSF18Q9UNG2 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TNFSF18Q9UNG2 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TNFSF18Q9UNG2 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TNFSF18Q9UNG2 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TNFSF18Q9UNG2 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TNFSF18Q9UNG2 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
TNFSF18Q9UNG2 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TNFSF18Q9UNG2 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
TNFSF18Q9UNG2 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TNFSF18Q9UNG2 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TNFSF18Q9UNG2 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
TNFSF18Q9UNG2 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TNFSF18Q9UNG2 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TNFSF18Q9UNG2 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TNFSF18Q9UNG2 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TNFSF18Q9UNG2 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TNFSF18Q9UNG2 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TNFSF18Q9UNG2 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TNFSF18Q9UNG2 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TNFSF18Q9UNG2 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TNFSF18Q9UNG2 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TNFSF18Q9UNG2 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TNFSF18Q9UNG2 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TNFSF18Q9UNG2 SPOCD1-201ENST00000257100 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TNFSF18Q9UNG2 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TNFSF18Q9UNG2 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TNFSF18Q9UNG2 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TNFSF18Q9UNG2 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TNFSF18Q9UNG2 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TNFSF18Q9UNG2 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TNFSF18Q9UNG2 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TNFSF18Q9UNG2 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TNFSF18Q9UNG2 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TNFSF18Q9UNG2 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TNFSF18Q9UNG2 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TNFSF18Q9UNG2 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TNFSF18Q9UNG2 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TNFSF18Q9UNG2 HGNC:18790-201ENST00000397958 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TNFSF18Q9UNG2 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TNFSF18Q9UNG2 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TNFSF18Q9UNG2 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TNFSF18Q9UNG2 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
TNFSF18Q9UNG2 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TNFSF18Q9UNG2 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TNFSF18Q9UNG2 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TNFSF18Q9UNG2 C7orf57-204ENST00000435376 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TNFSF18Q9UNG2 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TNFSF18Q9UNG2 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TNFSF18Q9UNG2 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TNFSF18Q9UNG2 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TNFSF18Q9UNG2 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TNFSF18Q9UNG2 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TNFSF18Q9UNG2 HAL-202ENST00000538703 2637 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TNFSF18Q9UNG2 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TNFSF18Q9UNG2 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TNFSF18Q9UNG2 C7orf57-206ENST00000539619 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TNFSF18Q9UNG2 IL20RA-207ENST00000541547 3382 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TNFSF18Q9UNG2 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TNFSF18Q9UNG2 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TNFSF18Q9UNG2 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TNFSF18Q9UNG2 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TNFSF18Q9UNG2 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
TNFSF18Q9UNG2 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TNFSF18Q9UNG2 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TNFSF18Q9UNG2 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
TNFSF18Q9UNG2 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TNFSF18Q9UNG2 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TNFSF18Q9UNG2 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
TNFSF18Q9UNG2 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TNFSF18Q9UNG2 ZBTB47-201ENST00000232974 3781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TNFSF18Q9UNG2 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TNFSF18Q9UNG2 ZNF202-206ENST00000529691 3384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TNFSF18Q9UNG2 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TNFSF18Q9UNG2 SCD5-202ENST00000319540 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TNFSF18Q9UNG2 VPS52-212ENST00000445902 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TNFSF18Q9UNG2 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TNFSF18Q9UNG2 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TNFSF18Q9UNG2 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TNFSF18Q9UNG2 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TNFSF18Q9UNG2 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TNFSF18Q9UNG2 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TNFSF18Q9UNG2 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TNFSF18Q9UNG2 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TNFSF18Q9UNG2 ALAS1-204ENST00000469224 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TNFSF18Q9UNG2 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TNFSF18Q9UNG2 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TNFSF18Q9UNG2 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TNFSF18Q9UNG2 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TNFSF18Q9UNG2 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TNFSF18Q9UNG2 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TNFSF18Q9UNG2 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TNFSF18Q9UNG2 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
TNFSF18Q9UNG2 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TNFSF18Q9UNG2 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TNFSF18Q9UNG2 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TNFSF18Q9UNG2 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TNFSF18Q9UNG2 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TNFSF18Q9UNG2 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TNFSF18Q9UNG2 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms