Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD4

BRPF3, Bromodomain and PHD finger-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF3Q9ULD4 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BRPF3Q9ULD4 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BRPF3Q9ULD4 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BRPF3Q9ULD4 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BRPF3Q9ULD4 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BRPF3Q9ULD4 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BRPF3Q9ULD4 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BRPF3Q9ULD4 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BRPF3Q9ULD4 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BRPF3Q9ULD4 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BRPF3Q9ULD4 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BRPF3Q9ULD4 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BRPF3Q9ULD4 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BRPF3Q9ULD4 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BRPF3Q9ULD4 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BRPF3Q9ULD4 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BRPF3Q9ULD4 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BRPF3Q9ULD4 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BRPF3Q9ULD4 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
BRPF3Q9ULD4 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BRPF3Q9ULD4 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
BRPF3Q9ULD4 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BRPF3Q9ULD4 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BRPF3Q9ULD4 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BRPF3Q9ULD4 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BRPF3Q9ULD4 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BRPF3Q9ULD4 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BRPF3Q9ULD4 HAL-202ENST00000538703 2637 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BRPF3Q9ULD4 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BRPF3Q9ULD4 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BRPF3Q9ULD4 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BRPF3Q9ULD4 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
BRPF3Q9ULD4 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BRPF3Q9ULD4 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
BRPF3Q9ULD4 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BRPF3Q9ULD4 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
BRPF3Q9ULD4 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BRPF3Q9ULD4 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BRPF3Q9ULD4 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BRPF3Q9ULD4 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
BRPF3Q9ULD4 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BRPF3Q9ULD4 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BRPF3Q9ULD4 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BRPF3Q9ULD4 MAP7-204ENST00000454590 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
BRPF3Q9ULD4 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BRPF3Q9ULD4 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC19■□□□□ 0.63
BRPF3Q9ULD4 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
BRPF3Q9ULD4 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
BRPF3Q9ULD4 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
BRPF3Q9ULD4 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC19■□□□□ 0.63
BRPF3Q9ULD4 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BRPF3Q9ULD4 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BRPF3Q9ULD4 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
BRPF3Q9ULD4 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
BRPF3Q9ULD4 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BRPF3Q9ULD4 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BRPF3Q9ULD4 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BRPF3Q9ULD4 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BRPF3Q9ULD4 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC19■□□□□ 0.63
BRPF3Q9ULD4 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BRPF3Q9ULD4 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BRPF3Q9ULD4 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BRPF3Q9ULD4 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
BRPF3Q9ULD4 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BRPF3Q9ULD4 SLC27A4-201ENST00000300456 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BRPF3Q9ULD4 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BRPF3Q9ULD4 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BRPF3Q9ULD4 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BRPF3Q9ULD4 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BRPF3Q9ULD4 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BRPF3Q9ULD4 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BRPF3Q9ULD4 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
BRPF3Q9ULD4 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BRPF3Q9ULD4 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BRPF3Q9ULD4 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BRPF3Q9ULD4 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
BRPF3Q9ULD4 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BRPF3Q9ULD4 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BRPF3Q9ULD4 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
BRPF3Q9ULD4 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BRPF3Q9ULD4 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
BRPF3Q9ULD4 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BRPF3Q9ULD4 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
BRPF3Q9ULD4 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
BRPF3Q9ULD4 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BRPF3Q9ULD4 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
BRPF3Q9ULD4 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
BRPF3Q9ULD4 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
BRPF3Q9ULD4 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
BRPF3Q9ULD4 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
BRPF3Q9ULD4 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
BRPF3Q9ULD4 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
BRPF3Q9ULD4 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
BRPF3Q9ULD4 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BRPF3Q9ULD4 CFAP65-203ENST00000409865 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
BRPF3Q9ULD4 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BRPF3Q9ULD4 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
BRPF3Q9ULD4 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BRPF3Q9ULD4 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BRPF3Q9ULD4 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.4 ms