Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU6

FAM8A1, Protein FAM8A1, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM8A1Q9UBU6 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM8A1Q9UBU6 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM8A1Q9UBU6 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM8A1Q9UBU6 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM8A1Q9UBU6 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM8A1Q9UBU6 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM8A1Q9UBU6 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM8A1Q9UBU6 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM8A1Q9UBU6 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM8A1Q9UBU6 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM8A1Q9UBU6 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM8A1Q9UBU6 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM8A1Q9UBU6 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM8A1Q9UBU6 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM8A1Q9UBU6 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM8A1Q9UBU6 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM8A1Q9UBU6 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM8A1Q9UBU6 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM8A1Q9UBU6 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM8A1Q9UBU6 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM8A1Q9UBU6 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM8A1Q9UBU6 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM8A1Q9UBU6 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM8A1Q9UBU6 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM8A1Q9UBU6 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM8A1Q9UBU6 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM8A1Q9UBU6 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM8A1Q9UBU6 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM8A1Q9UBU6 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM8A1Q9UBU6 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM8A1Q9UBU6 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM8A1Q9UBU6 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM8A1Q9UBU6 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM8A1Q9UBU6 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM8A1Q9UBU6 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM8A1Q9UBU6 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM8A1Q9UBU6 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM8A1Q9UBU6 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM8A1Q9UBU6 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM8A1Q9UBU6 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM8A1Q9UBU6 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM8A1Q9UBU6 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM8A1Q9UBU6 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM8A1Q9UBU6 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM8A1Q9UBU6 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM8A1Q9UBU6 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM8A1Q9UBU6 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM8A1Q9UBU6 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM8A1Q9UBU6 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM8A1Q9UBU6 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM8A1Q9UBU6 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM8A1Q9UBU6 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM8A1Q9UBU6 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM8A1Q9UBU6 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM8A1Q9UBU6 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM8A1Q9UBU6 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM8A1Q9UBU6 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM8A1Q9UBU6 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM8A1Q9UBU6 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM8A1Q9UBU6 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM8A1Q9UBU6 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM8A1Q9UBU6 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM8A1Q9UBU6 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM8A1Q9UBU6 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM8A1Q9UBU6 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM8A1Q9UBU6 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM8A1Q9UBU6 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM8A1Q9UBU6 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM8A1Q9UBU6 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM8A1Q9UBU6 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM8A1Q9UBU6 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM8A1Q9UBU6 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM8A1Q9UBU6 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM8A1Q9UBU6 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM8A1Q9UBU6 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM8A1Q9UBU6 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM8A1Q9UBU6 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM8A1Q9UBU6 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM8A1Q9UBU6 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM8A1Q9UBU6 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM8A1Q9UBU6 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM8A1Q9UBU6 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM8A1Q9UBU6 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM8A1Q9UBU6 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM8A1Q9UBU6 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM8A1Q9UBU6 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM8A1Q9UBU6 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM8A1Q9UBU6 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM8A1Q9UBU6 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM8A1Q9UBU6 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM8A1Q9UBU6 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM8A1Q9UBU6 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM8A1Q9UBU6 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM8A1Q9UBU6 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM8A1Q9UBU6 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM8A1Q9UBU6 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM8A1Q9UBU6 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM8A1Q9UBU6 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM8A1Q9UBU6 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM8A1Q9UBU6 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms