Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN4

TRPC4, Short transient receptor potential channel 4, humanhuman

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC4Q9UBN4 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRPC4Q9UBN4 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRPC4Q9UBN4 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRPC4Q9UBN4 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRPC4Q9UBN4 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
TRPC4Q9UBN4 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
TRPC4Q9UBN4 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
TRPC4Q9UBN4 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
TRPC4Q9UBN4 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRPC4Q9UBN4 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TRPC4Q9UBN4 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TRPC4Q9UBN4 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TRPC4Q9UBN4 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TRPC4Q9UBN4 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
TRPC4Q9UBN4 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
TRPC4Q9UBN4 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
TRPC4Q9UBN4 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRPC4Q9UBN4 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TRPC4Q9UBN4 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TRPC4Q9UBN4 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TRPC4Q9UBN4 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TRPC4Q9UBN4 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRPC4Q9UBN4 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TRPC4Q9UBN4 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRPC4Q9UBN4 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRPC4Q9UBN4 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRPC4Q9UBN4 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRPC4Q9UBN4 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TRPC4Q9UBN4 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TRPC4Q9UBN4 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TRPC4Q9UBN4 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TRPC4Q9UBN4 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TRPC4Q9UBN4 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TRPC4Q9UBN4 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TRPC4Q9UBN4 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TRPC4Q9UBN4 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TRPC4Q9UBN4 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TRPC4Q9UBN4 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TRPC4Q9UBN4 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TRPC4Q9UBN4 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TRPC4Q9UBN4 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TRPC4Q9UBN4 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TRPC4Q9UBN4 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TRPC4Q9UBN4 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TRPC4Q9UBN4 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TRPC4Q9UBN4 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TRPC4Q9UBN4 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
TRPC4Q9UBN4 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
TRPC4Q9UBN4 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TRPC4Q9UBN4 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TRPC4Q9UBN4 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TRPC4Q9UBN4 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TRPC4Q9UBN4 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC15.02■□□□□ -0
TRPC4Q9UBN4 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TRPC4Q9UBN4 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TRPC4Q9UBN4 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TRPC4Q9UBN4 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TRPC4Q9UBN4 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TRPC4Q9UBN4 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TRPC4Q9UBN4 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
TRPC4Q9UBN4 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TRPC4Q9UBN4 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC15.02■□□□□ -0
TRPC4Q9UBN4 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
TRPC4Q9UBN4 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.02■□□□□ -0
TRPC4Q9UBN4 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.02■□□□□ -0
TRPC4Q9UBN4 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
TRPC4Q9UBN4 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TRPC4Q9UBN4 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TRPC4Q9UBN4 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TRPC4Q9UBN4 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TRPC4Q9UBN4 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TRPC4Q9UBN4 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TRPC4Q9UBN4 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TRPC4Q9UBN4 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TRPC4Q9UBN4 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TRPC4Q9UBN4 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TRPC4Q9UBN4 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TRPC4Q9UBN4 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TRPC4Q9UBN4 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRPC4Q9UBN4 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRPC4Q9UBN4 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRPC4Q9UBN4 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRPC4Q9UBN4 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
TRPC4Q9UBN4 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRPC4Q9UBN4 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRPC4Q9UBN4 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRPC4Q9UBN4 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRPC4Q9UBN4 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRPC4Q9UBN4 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
TRPC4Q9UBN4 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRPC4Q9UBN4 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRPC4Q9UBN4 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRPC4Q9UBN4 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRPC4Q9UBN4 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRPC4Q9UBN4 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRPC4Q9UBN4 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRPC4Q9UBN4 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRPC4Q9UBN4 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRPC4Q9UBN4 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRPC4Q9UBN4 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.2 ms