Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA3

CTNNBIP1, Beta-catenin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNBIP1Q9NSA3 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms