Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRE1

MMP26, Matrix metalloproteinase-26, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP26Q9NRE1 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
MMP26Q9NRE1 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
MMP26Q9NRE1 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
MMP26Q9NRE1 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
MMP26Q9NRE1 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
MMP26Q9NRE1 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
MMP26Q9NRE1 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
MMP26Q9NRE1 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
MMP26Q9NRE1 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
MMP26Q9NRE1 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
MMP26Q9NRE1 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
MMP26Q9NRE1 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
MMP26Q9NRE1 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
MMP26Q9NRE1 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
MMP26Q9NRE1 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
MMP26Q9NRE1 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
MMP26Q9NRE1 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
MMP26Q9NRE1 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
MMP26Q9NRE1 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC13.46□□□□□ -0.25
MMP26Q9NRE1 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
MMP26Q9NRE1 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
MMP26Q9NRE1 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
MMP26Q9NRE1 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
MMP26Q9NRE1 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC13.46□□□□□ -0.25
MMP26Q9NRE1 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
MMP26Q9NRE1 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
MMP26Q9NRE1 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC13.46□□□□□ -0.25
MMP26Q9NRE1 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
MMP26Q9NRE1 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
MMP26Q9NRE1 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
MMP26Q9NRE1 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
MMP26Q9NRE1 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
MMP26Q9NRE1 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
MMP26Q9NRE1 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
MMP26Q9NRE1 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
MMP26Q9NRE1 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
MMP26Q9NRE1 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
MMP26Q9NRE1 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
MMP26Q9NRE1 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
MMP26Q9NRE1 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
MMP26Q9NRE1 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
MMP26Q9NRE1 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
MMP26Q9NRE1 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
MMP26Q9NRE1 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
MMP26Q9NRE1 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
MMP26Q9NRE1 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
MMP26Q9NRE1 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
MMP26Q9NRE1 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
MMP26Q9NRE1 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
MMP26Q9NRE1 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
MMP26Q9NRE1 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
MMP26Q9NRE1 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
MMP26Q9NRE1 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
MMP26Q9NRE1 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
MMP26Q9NRE1 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
MMP26Q9NRE1 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
MMP26Q9NRE1 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
MMP26Q9NRE1 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
MMP26Q9NRE1 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
MMP26Q9NRE1 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
MMP26Q9NRE1 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
MMP26Q9NRE1 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
MMP26Q9NRE1 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
MMP26Q9NRE1 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
MMP26Q9NRE1 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
MMP26Q9NRE1 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
MMP26Q9NRE1 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
MMP26Q9NRE1 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
MMP26Q9NRE1 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
MMP26Q9NRE1 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
MMP26Q9NRE1 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
MMP26Q9NRE1 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
MMP26Q9NRE1 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
MMP26Q9NRE1 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
MMP26Q9NRE1 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
MMP26Q9NRE1 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
MMP26Q9NRE1 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
MMP26Q9NRE1 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
MMP26Q9NRE1 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
MMP26Q9NRE1 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
MMP26Q9NRE1 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
MMP26Q9NRE1 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
MMP26Q9NRE1 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
MMP26Q9NRE1 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
MMP26Q9NRE1 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
MMP26Q9NRE1 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
MMP26Q9NRE1 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
MMP26Q9NRE1 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
MMP26Q9NRE1 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
MMP26Q9NRE1 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
MMP26Q9NRE1 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
MMP26Q9NRE1 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
MMP26Q9NRE1 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
MMP26Q9NRE1 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
MMP26Q9NRE1 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
MMP26Q9NRE1 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
MMP26Q9NRE1 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
MMP26Q9NRE1 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
MMP26Q9NRE1 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
MMP26Q9NRE1 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.4 ms