Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPY3

CD93, Complement component C1q receptor, humanhuman

Predictions only

Length 652 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD93Q9NPY3 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD93Q9NPY3 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD93Q9NPY3 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD93Q9NPY3 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD93Q9NPY3 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD93Q9NPY3 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD93Q9NPY3 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD93Q9NPY3 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD93Q9NPY3 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD93Q9NPY3 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD93Q9NPY3 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD93Q9NPY3 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD93Q9NPY3 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD93Q9NPY3 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD93Q9NPY3 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD93Q9NPY3 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD93Q9NPY3 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD93Q9NPY3 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD93Q9NPY3 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD93Q9NPY3 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CD93Q9NPY3 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD93Q9NPY3 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD93Q9NPY3 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD93Q9NPY3 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD93Q9NPY3 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD93Q9NPY3 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD93Q9NPY3 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD93Q9NPY3 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD93Q9NPY3 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD93Q9NPY3 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD93Q9NPY3 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CD93Q9NPY3 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD93Q9NPY3 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD93Q9NPY3 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD93Q9NPY3 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD93Q9NPY3 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD93Q9NPY3 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD93Q9NPY3 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD93Q9NPY3 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD93Q9NPY3 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD93Q9NPY3 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD93Q9NPY3 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD93Q9NPY3 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD93Q9NPY3 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD93Q9NPY3 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD93Q9NPY3 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD93Q9NPY3 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD93Q9NPY3 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD93Q9NPY3 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD93Q9NPY3 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD93Q9NPY3 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD93Q9NPY3 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD93Q9NPY3 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD93Q9NPY3 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD93Q9NPY3 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD93Q9NPY3 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD93Q9NPY3 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD93Q9NPY3 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD93Q9NPY3 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD93Q9NPY3 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD93Q9NPY3 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD93Q9NPY3 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD93Q9NPY3 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD93Q9NPY3 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD93Q9NPY3 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD93Q9NPY3 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CD93Q9NPY3 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD93Q9NPY3 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD93Q9NPY3 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CD93Q9NPY3 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD93Q9NPY3 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD93Q9NPY3 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD93Q9NPY3 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CD93Q9NPY3 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD93Q9NPY3 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD93Q9NPY3 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CD93Q9NPY3 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD93Q9NPY3 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD93Q9NPY3 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD93Q9NPY3 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD93Q9NPY3 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD93Q9NPY3 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD93Q9NPY3 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD93Q9NPY3 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD93Q9NPY3 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD93Q9NPY3 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD93Q9NPY3 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD93Q9NPY3 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD93Q9NPY3 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD93Q9NPY3 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD93Q9NPY3 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD93Q9NPY3 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD93Q9NPY3 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD93Q9NPY3 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD93Q9NPY3 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD93Q9NPY3 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD93Q9NPY3 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD93Q9NPY3 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD93Q9NPY3 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD93Q9NPY3 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms