Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP72

RAB18, Ras-related protein Rab-18, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB18Q9NP72 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms