Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCU9

BRMS1, Breast cancer metastasis-suppressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1Q9HCU9 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BRMS1Q9HCU9 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BRMS1Q9HCU9 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BRMS1Q9HCU9 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BRMS1Q9HCU9 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BRMS1Q9HCU9 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BRMS1Q9HCU9 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BRMS1Q9HCU9 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BRMS1Q9HCU9 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BRMS1Q9HCU9 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BRMS1Q9HCU9 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
BRMS1Q9HCU9 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BRMS1Q9HCU9 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BRMS1Q9HCU9 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BRMS1Q9HCU9 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BRMS1Q9HCU9 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BRMS1Q9HCU9 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BRMS1Q9HCU9 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BRMS1Q9HCU9 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BRMS1Q9HCU9 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BRMS1Q9HCU9 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BRMS1Q9HCU9 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BRMS1Q9HCU9 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BRMS1Q9HCU9 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BRMS1Q9HCU9 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BRMS1Q9HCU9 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BRMS1Q9HCU9 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BRMS1Q9HCU9 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BRMS1Q9HCU9 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BRMS1Q9HCU9 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
BRMS1Q9HCU9 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
BRMS1Q9HCU9 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BRMS1Q9HCU9 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
BRMS1Q9HCU9 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BRMS1Q9HCU9 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BRMS1Q9HCU9 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BRMS1Q9HCU9 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BRMS1Q9HCU9 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
BRMS1Q9HCU9 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
BRMS1Q9HCU9 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
BRMS1Q9HCU9 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
BRMS1Q9HCU9 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
BRMS1Q9HCU9 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
BRMS1Q9HCU9 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
BRMS1Q9HCU9 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
BRMS1Q9HCU9 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
BRMS1Q9HCU9 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
BRMS1Q9HCU9 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
BRMS1Q9HCU9 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
BRMS1Q9HCU9 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BRMS1Q9HCU9 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
BRMS1Q9HCU9 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BRMS1Q9HCU9 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BRMS1Q9HCU9 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BRMS1Q9HCU9 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BRMS1Q9HCU9 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BRMS1Q9HCU9 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BRMS1Q9HCU9 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BRMS1Q9HCU9 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BRMS1Q9HCU9 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BRMS1Q9HCU9 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BRMS1Q9HCU9 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BRMS1Q9HCU9 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BRMS1Q9HCU9 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
BRMS1Q9HCU9 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BRMS1Q9HCU9 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
BRMS1Q9HCU9 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BRMS1Q9HCU9 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
BRMS1Q9HCU9 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
BRMS1Q9HCU9 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BRMS1Q9HCU9 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BRMS1Q9HCU9 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BRMS1Q9HCU9 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BRMS1Q9HCU9 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BRMS1Q9HCU9 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BRMS1Q9HCU9 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BRMS1Q9HCU9 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BRMS1Q9HCU9 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BRMS1Q9HCU9 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BRMS1Q9HCU9 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BRMS1Q9HCU9 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
BRMS1Q9HCU9 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BRMS1Q9HCU9 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BRMS1Q9HCU9 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC18■□□□□ 0.47
BRMS1Q9HCU9 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
BRMS1Q9HCU9 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
BRMS1Q9HCU9 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BRMS1Q9HCU9 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
BRMS1Q9HCU9 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BRMS1Q9HCU9 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
BRMS1Q9HCU9 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
BRMS1Q9HCU9 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
BRMS1Q9HCU9 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
BRMS1Q9HCU9 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
BRMS1Q9HCU9 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BRMS1Q9HCU9 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BRMS1Q9HCU9 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
BRMS1Q9HCU9 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
BRMS1Q9HCU9 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
BRMS1Q9HCU9 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms