Protein–RNA interactions for Protein: Q9HA38

ZMAT3, Zinc finger matrin-type protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZMAT3Q9HA38 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ZMAT3Q9HA38 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
ZMAT3Q9HA38 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ZMAT3Q9HA38 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
ZMAT3Q9HA38 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ZMAT3Q9HA38 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
ZMAT3Q9HA38 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
ZMAT3Q9HA38 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ZMAT3Q9HA38 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ZMAT3Q9HA38 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ZMAT3Q9HA38 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
ZMAT3Q9HA38 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
ZMAT3Q9HA38 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
ZMAT3Q9HA38 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ZMAT3Q9HA38 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ZMAT3Q9HA38 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZMAT3Q9HA38 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZMAT3Q9HA38 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZMAT3Q9HA38 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZMAT3Q9HA38 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZMAT3Q9HA38 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZMAT3Q9HA38 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZMAT3Q9HA38 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZMAT3Q9HA38 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZMAT3Q9HA38 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZMAT3Q9HA38 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZMAT3Q9HA38 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZMAT3Q9HA38 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZMAT3Q9HA38 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZMAT3Q9HA38 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZMAT3Q9HA38 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZMAT3Q9HA38 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZMAT3Q9HA38 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZMAT3Q9HA38 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZMAT3Q9HA38 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZMAT3Q9HA38 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
ZMAT3Q9HA38 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
ZMAT3Q9HA38 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
ZMAT3Q9HA38 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
ZMAT3Q9HA38 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
ZMAT3Q9HA38 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZMAT3Q9HA38 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZMAT3Q9HA38 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZMAT3Q9HA38 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZMAT3Q9HA38 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZMAT3Q9HA38 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZMAT3Q9HA38 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZMAT3Q9HA38 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZMAT3Q9HA38 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
ZMAT3Q9HA38 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZMAT3Q9HA38 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZMAT3Q9HA38 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
ZMAT3Q9HA38 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZMAT3Q9HA38 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZMAT3Q9HA38 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZMAT3Q9HA38 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZMAT3Q9HA38 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZMAT3Q9HA38 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZMAT3Q9HA38 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZMAT3Q9HA38 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZMAT3Q9HA38 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZMAT3Q9HA38 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZMAT3Q9HA38 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZMAT3Q9HA38 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZMAT3Q9HA38 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZMAT3Q9HA38 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZMAT3Q9HA38 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZMAT3Q9HA38 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZMAT3Q9HA38 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZMAT3Q9HA38 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZMAT3Q9HA38 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZMAT3Q9HA38 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZMAT3Q9HA38 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZMAT3Q9HA38 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZMAT3Q9HA38 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZMAT3Q9HA38 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
ZMAT3Q9HA38 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZMAT3Q9HA38 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZMAT3Q9HA38 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZMAT3Q9HA38 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
ZMAT3Q9HA38 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZMAT3Q9HA38 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZMAT3Q9HA38 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZMAT3Q9HA38 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
ZMAT3Q9HA38 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZMAT3Q9HA38 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZMAT3Q9HA38 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZMAT3Q9HA38 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZMAT3Q9HA38 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZMAT3Q9HA38 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZMAT3Q9HA38 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZMAT3Q9HA38 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZMAT3Q9HA38 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZMAT3Q9HA38 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZMAT3Q9HA38 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZMAT3Q9HA38 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZMAT3Q9HA38 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZMAT3Q9HA38 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZMAT3Q9HA38 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZMAT3Q9HA38 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms