Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE4

HERPUD2, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD2Q9BSE4 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERPUD2Q9BSE4 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERPUD2Q9BSE4 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERPUD2Q9BSE4 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERPUD2Q9BSE4 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERPUD2Q9BSE4 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERPUD2Q9BSE4 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERPUD2Q9BSE4 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HERPUD2Q9BSE4 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HERPUD2Q9BSE4 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERPUD2Q9BSE4 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERPUD2Q9BSE4 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERPUD2Q9BSE4 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERPUD2Q9BSE4 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERPUD2Q9BSE4 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERPUD2Q9BSE4 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERPUD2Q9BSE4 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERPUD2Q9BSE4 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERPUD2Q9BSE4 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERPUD2Q9BSE4 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERPUD2Q9BSE4 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERPUD2Q9BSE4 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERPUD2Q9BSE4 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERPUD2Q9BSE4 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERPUD2Q9BSE4 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERPUD2Q9BSE4 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERPUD2Q9BSE4 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERPUD2Q9BSE4 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERPUD2Q9BSE4 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERPUD2Q9BSE4 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERPUD2Q9BSE4 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERPUD2Q9BSE4 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERPUD2Q9BSE4 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERPUD2Q9BSE4 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERPUD2Q9BSE4 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERPUD2Q9BSE4 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERPUD2Q9BSE4 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERPUD2Q9BSE4 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERPUD2Q9BSE4 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERPUD2Q9BSE4 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERPUD2Q9BSE4 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERPUD2Q9BSE4 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERPUD2Q9BSE4 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERPUD2Q9BSE4 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERPUD2Q9BSE4 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERPUD2Q9BSE4 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERPUD2Q9BSE4 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERPUD2Q9BSE4 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERPUD2Q9BSE4 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERPUD2Q9BSE4 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERPUD2Q9BSE4 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERPUD2Q9BSE4 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERPUD2Q9BSE4 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERPUD2Q9BSE4 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
HERPUD2Q9BSE4 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERPUD2Q9BSE4 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERPUD2Q9BSE4 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERPUD2Q9BSE4 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERPUD2Q9BSE4 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERPUD2Q9BSE4 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERPUD2Q9BSE4 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERPUD2Q9BSE4 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERPUD2Q9BSE4 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERPUD2Q9BSE4 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERPUD2Q9BSE4 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERPUD2Q9BSE4 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERPUD2Q9BSE4 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERPUD2Q9BSE4 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERPUD2Q9BSE4 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERPUD2Q9BSE4 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERPUD2Q9BSE4 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
HERPUD2Q9BSE4 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERPUD2Q9BSE4 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERPUD2Q9BSE4 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERPUD2Q9BSE4 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERPUD2Q9BSE4 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERPUD2Q9BSE4 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERPUD2Q9BSE4 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERPUD2Q9BSE4 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERPUD2Q9BSE4 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERPUD2Q9BSE4 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERPUD2Q9BSE4 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERPUD2Q9BSE4 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERPUD2Q9BSE4 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERPUD2Q9BSE4 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERPUD2Q9BSE4 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERPUD2Q9BSE4 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERPUD2Q9BSE4 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERPUD2Q9BSE4 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERPUD2Q9BSE4 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERPUD2Q9BSE4 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERPUD2Q9BSE4 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HERPUD2Q9BSE4 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERPUD2Q9BSE4 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERPUD2Q9BSE4 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERPUD2Q9BSE4 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERPUD2Q9BSE4 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERPUD2Q9BSE4 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERPUD2Q9BSE4 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HERPUD2Q9BSE4 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms