Protein–RNA interactions for Protein: Q96L96

ALPK3, Alpha-protein kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALPK3Q96L96 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ALPK3Q96L96 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ALPK3Q96L96 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ALPK3Q96L96 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ALPK3Q96L96 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ALPK3Q96L96 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ALPK3Q96L96 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ALPK3Q96L96 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ALPK3Q96L96 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ALPK3Q96L96 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ALPK3Q96L96 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ALPK3Q96L96 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ALPK3Q96L96 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ALPK3Q96L96 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ALPK3Q96L96 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ALPK3Q96L96 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ALPK3Q96L96 UROS-201ENST00000368774 744 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ALPK3Q96L96 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ALPK3Q96L96 STK16-203ENST00000409516 895 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ALPK3Q96L96 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ALPK3Q96L96 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ALPK3Q96L96 NOP16-211ENST00000621444 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ALPK3Q96L96 AC073592.2-201ENST00000623062 780 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ALPK3Q96L96 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ALPK3Q96L96 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ALPK3Q96L96 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ALPK3Q96L96 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ALPK3Q96L96 LINC02537-201ENST00000635943 1367 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ALPK3Q96L96 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ALPK3Q96L96 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ALPK3Q96L96 TAGLN3-201ENST00000273368 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ALPK3Q96L96 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ALPK3Q96L96 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ALPK3Q96L96 SGCA-201ENST00000262018 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ALPK3Q96L96 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ALPK3Q96L96 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ALPK3Q96L96 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ALPK3Q96L96 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ALPK3Q96L96 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ALPK3Q96L96 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ALPK3Q96L96 TNFSF11-201ENST00000239849 911 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ALPK3Q96L96 POLR2L-201ENST00000322028 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ALPK3Q96L96 S100A3-202ENST00000368713 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ALPK3Q96L96 SPIN2B-203ENST00000374910 725 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ALPK3Q96L96 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ALPK3Q96L96 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ALPK3Q96L96 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ALPK3Q96L96 AC129102.1-201ENST00000535755 525 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ALPK3Q96L96 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ALPK3Q96L96 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ALPK3Q96L96 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ALPK3Q96L96 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ALPK3Q96L96 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ALPK3Q96L96 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ALPK3Q96L96 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ALPK3Q96L96 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ALPK3Q96L96 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ALPK3Q96L96 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ALPK3Q96L96 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ALPK3Q96L96 AL606748.1-201ENST00000423919 655 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ALPK3Q96L96 KRT17P4-201ENST00000429445 819 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ALPK3Q96L96 PRKAR2A-AS1-203ENST00000431705 592 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ALPK3Q96L96 DDX39AP1-201ENST00000445147 1181 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ALPK3Q96L96 HIST2H2BF-204ENST00000545683 999 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ALPK3Q96L96 MIR3180-2-201ENST00000581748 88 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ALPK3Q96L96 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ALPK3Q96L96 AL138720.1-201ENST00000629853 778 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ALPK3Q96L96 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ALPK3Q96L96 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ALPK3Q96L96 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ALPK3Q96L96 PRPF18-202ENST00000378572 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ALPK3Q96L96 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ALPK3Q96L96 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ALPK3Q96L96 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ALPK3Q96L96 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ALPK3Q96L96 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ALPK3Q96L96 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ALPK3Q96L96 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ALPK3Q96L96 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ALPK3Q96L96 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ALPK3Q96L96 KRTAP1-3-201ENST00000344363 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ALPK3Q96L96 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ALPK3Q96L96 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ALPK3Q96L96 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ALPK3Q96L96 NUDT4P2-201ENST00000578341 546 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ALPK3Q96L96 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ALPK3Q96L96 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ALPK3Q96L96 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ALPK3Q96L96 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ALPK3Q96L96 C20orf96-202ENST00000382369 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ALPK3Q96L96 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ALPK3Q96L96 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ALPK3Q96L96 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ALPK3Q96L96 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ALPK3Q96L96 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ALPK3Q96L96 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ALPK3Q96L96 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ALPK3Q96L96 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ALPK3Q96L96 AC233724.6-201ENST00000503184 1088 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ALPK3Q96L96 TGFB3-204ENST00000556285 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms