Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
COG3Q96JB2 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
COG3Q96JB2 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
COG3Q96JB2 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
COG3Q96JB2 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
COG3Q96JB2 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
COG3Q96JB2 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
COG3Q96JB2 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
COG3Q96JB2 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
COG3Q96JB2 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
COG3Q96JB2 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
COG3Q96JB2 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
COG3Q96JB2 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
COG3Q96JB2 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
COG3Q96JB2 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
COG3Q96JB2 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
COG3Q96JB2 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
COG3Q96JB2 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
COG3Q96JB2 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
COG3Q96JB2 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
COG3Q96JB2 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
COG3Q96JB2 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
COG3Q96JB2 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
COG3Q96JB2 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
COG3Q96JB2 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
COG3Q96JB2 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
COG3Q96JB2 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
COG3Q96JB2 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
COG3Q96JB2 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
COG3Q96JB2 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
COG3Q96JB2 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
COG3Q96JB2 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
COG3Q96JB2 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
COG3Q96JB2 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
COG3Q96JB2 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
COG3Q96JB2 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
COG3Q96JB2 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
COG3Q96JB2 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
COG3Q96JB2 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
COG3Q96JB2 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
COG3Q96JB2 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
COG3Q96JB2 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
COG3Q96JB2 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
COG3Q96JB2 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
COG3Q96JB2 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
COG3Q96JB2 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
COG3Q96JB2 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
COG3Q96JB2 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
COG3Q96JB2 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
COG3Q96JB2 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
COG3Q96JB2 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
COG3Q96JB2 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
COG3Q96JB2 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
COG3Q96JB2 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
COG3Q96JB2 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
COG3Q96JB2 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
COG3Q96JB2 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
COG3Q96JB2 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
COG3Q96JB2 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
COG3Q96JB2 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
COG3Q96JB2 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
COG3Q96JB2 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
COG3Q96JB2 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
COG3Q96JB2 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
COG3Q96JB2 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
COG3Q96JB2 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
COG3Q96JB2 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
COG3Q96JB2 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
COG3Q96JB2 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
COG3Q96JB2 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
COG3Q96JB2 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
COG3Q96JB2 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
COG3Q96JB2 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
COG3Q96JB2 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
COG3Q96JB2 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
COG3Q96JB2 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
COG3Q96JB2 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
COG3Q96JB2 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
COG3Q96JB2 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
COG3Q96JB2 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
COG3Q96JB2 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
COG3Q96JB2 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
COG3Q96JB2 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
COG3Q96JB2 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
COG3Q96JB2 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
COG3Q96JB2 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
COG3Q96JB2 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
COG3Q96JB2 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
COG3Q96JB2 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
COG3Q96JB2 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
COG3Q96JB2 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
COG3Q96JB2 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
COG3Q96JB2 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
COG3Q96JB2 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
COG3Q96JB2 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
COG3Q96JB2 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
COG3Q96JB2 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
COG3Q96JB2 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
COG3Q96JB2 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
COG3Q96JB2 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms