Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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ZNF548Q8NEK5 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
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