Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9W5

DNAAF3, Dynein assembly factor 3, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAAF3Q8N9W5 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DNAAF3Q8N9W5 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DNAAF3Q8N9W5 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DNAAF3Q8N9W5 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DNAAF3Q8N9W5 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DNAAF3Q8N9W5 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DNAAF3Q8N9W5 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DNAAF3Q8N9W5 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DNAAF3Q8N9W5 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DNAAF3Q8N9W5 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
DNAAF3Q8N9W5 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
DNAAF3Q8N9W5 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DNAAF3Q8N9W5 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
DNAAF3Q8N9W5 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DNAAF3Q8N9W5 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
DNAAF3Q8N9W5 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DNAAF3Q8N9W5 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
DNAAF3Q8N9W5 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DNAAF3Q8N9W5 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
DNAAF3Q8N9W5 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DNAAF3Q8N9W5 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DNAAF3Q8N9W5 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DNAAF3Q8N9W5 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DNAAF3Q8N9W5 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DNAAF3Q8N9W5 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DNAAF3Q8N9W5 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DNAAF3Q8N9W5 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DNAAF3Q8N9W5 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DNAAF3Q8N9W5 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DNAAF3Q8N9W5 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DNAAF3Q8N9W5 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DNAAF3Q8N9W5 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DNAAF3Q8N9W5 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DNAAF3Q8N9W5 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DNAAF3Q8N9W5 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DNAAF3Q8N9W5 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DNAAF3Q8N9W5 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DNAAF3Q8N9W5 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
DNAAF3Q8N9W5 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DNAAF3Q8N9W5 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
DNAAF3Q8N9W5 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DNAAF3Q8N9W5 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DNAAF3Q8N9W5 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DNAAF3Q8N9W5 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DNAAF3Q8N9W5 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
DNAAF3Q8N9W5 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DNAAF3Q8N9W5 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DNAAF3Q8N9W5 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DNAAF3Q8N9W5 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DNAAF3Q8N9W5 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DNAAF3Q8N9W5 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DNAAF3Q8N9W5 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DNAAF3Q8N9W5 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DNAAF3Q8N9W5 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DNAAF3Q8N9W5 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DNAAF3Q8N9W5 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
DNAAF3Q8N9W5 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DNAAF3Q8N9W5 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
DNAAF3Q8N9W5 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DNAAF3Q8N9W5 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DNAAF3Q8N9W5 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DNAAF3Q8N9W5 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
DNAAF3Q8N9W5 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DNAAF3Q8N9W5 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DNAAF3Q8N9W5 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DNAAF3Q8N9W5 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DNAAF3Q8N9W5 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DNAAF3Q8N9W5 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DNAAF3Q8N9W5 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DNAAF3Q8N9W5 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
DNAAF3Q8N9W5 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DNAAF3Q8N9W5 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DNAAF3Q8N9W5 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DNAAF3Q8N9W5 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DNAAF3Q8N9W5 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DNAAF3Q8N9W5 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DNAAF3Q8N9W5 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DNAAF3Q8N9W5 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DNAAF3Q8N9W5 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DNAAF3Q8N9W5 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DNAAF3Q8N9W5 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DNAAF3Q8N9W5 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
DNAAF3Q8N9W5 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DNAAF3Q8N9W5 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DNAAF3Q8N9W5 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DNAAF3Q8N9W5 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DNAAF3Q8N9W5 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DNAAF3Q8N9W5 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DNAAF3Q8N9W5 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DNAAF3Q8N9W5 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
DNAAF3Q8N9W5 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DNAAF3Q8N9W5 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DNAAF3Q8N9W5 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DNAAF3Q8N9W5 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DNAAF3Q8N9W5 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DNAAF3Q8N9W5 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DNAAF3Q8N9W5 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DNAAF3Q8N9W5 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DNAAF3Q8N9W5 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DNAAF3Q8N9W5 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms