Protein–RNA interactions for Protein: Q86W47

KCNMB4, Calcium-activated potassium channel subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB4Q86W47 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCNMB4Q86W47 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCNMB4Q86W47 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
KCNMB4Q86W47 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCNMB4Q86W47 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCNMB4Q86W47 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCNMB4Q86W47 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCNMB4Q86W47 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCNMB4Q86W47 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCNMB4Q86W47 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCNMB4Q86W47 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCNMB4Q86W47 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCNMB4Q86W47 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCNMB4Q86W47 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCNMB4Q86W47 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCNMB4Q86W47 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCNMB4Q86W47 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCNMB4Q86W47 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCNMB4Q86W47 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
KCNMB4Q86W47 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCNMB4Q86W47 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCNMB4Q86W47 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCNMB4Q86W47 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCNMB4Q86W47 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCNMB4Q86W47 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCNMB4Q86W47 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCNMB4Q86W47 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCNMB4Q86W47 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCNMB4Q86W47 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCNMB4Q86W47 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCNMB4Q86W47 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCNMB4Q86W47 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCNMB4Q86W47 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCNMB4Q86W47 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCNMB4Q86W47 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCNMB4Q86W47 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCNMB4Q86W47 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCNMB4Q86W47 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCNMB4Q86W47 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCNMB4Q86W47 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCNMB4Q86W47 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCNMB4Q86W47 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
KCNMB4Q86W47 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
KCNMB4Q86W47 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCNMB4Q86W47 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCNMB4Q86W47 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCNMB4Q86W47 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCNMB4Q86W47 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCNMB4Q86W47 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCNMB4Q86W47 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
KCNMB4Q86W47 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCNMB4Q86W47 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCNMB4Q86W47 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCNMB4Q86W47 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCNMB4Q86W47 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCNMB4Q86W47 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
KCNMB4Q86W47 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCNMB4Q86W47 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCNMB4Q86W47 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCNMB4Q86W47 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCNMB4Q86W47 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCNMB4Q86W47 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCNMB4Q86W47 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCNMB4Q86W47 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCNMB4Q86W47 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCNMB4Q86W47 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCNMB4Q86W47 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCNMB4Q86W47 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCNMB4Q86W47 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCNMB4Q86W47 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KCNMB4Q86W47 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KCNMB4Q86W47 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KCNMB4Q86W47 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KCNMB4Q86W47 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KCNMB4Q86W47 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KCNMB4Q86W47 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KCNMB4Q86W47 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KCNMB4Q86W47 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KCNMB4Q86W47 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KCNMB4Q86W47 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KCNMB4Q86W47 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KCNMB4Q86W47 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KCNMB4Q86W47 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KCNMB4Q86W47 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
KCNMB4Q86W47 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KCNMB4Q86W47 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
KCNMB4Q86W47 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KCNMB4Q86W47 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KCNMB4Q86W47 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KCNMB4Q86W47 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KCNMB4Q86W47 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KCNMB4Q86W47 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
KCNMB4Q86W47 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
KCNMB4Q86W47 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KCNMB4Q86W47 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KCNMB4Q86W47 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KCNMB4Q86W47 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KCNMB4Q86W47 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KCNMB4Q86W47 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KCNMB4Q86W47 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms