Protein–RNA interactions for Protein: Q86U86

PBRM1, Protein polybromo-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBRM1Q86U86 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PBRM1Q86U86 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PBRM1Q86U86 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PBRM1Q86U86 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PBRM1Q86U86 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PBRM1Q86U86 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PBRM1Q86U86 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PBRM1Q86U86 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PBRM1Q86U86 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PBRM1Q86U86 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PBRM1Q86U86 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PBRM1Q86U86 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PBRM1Q86U86 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PBRM1Q86U86 C8G-201ENST00000224181 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PBRM1Q86U86 PIGF-202ENST00000306465 1061 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PBRM1Q86U86 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PBRM1Q86U86 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PBRM1Q86U86 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PBRM1Q86U86 PSMD4P1-201ENST00000433951 1109 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PBRM1Q86U86 PTGES3-203ENST00000436399 941 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PBRM1Q86U86 AL157788.1-201ENST00000437838 229 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PBRM1Q86U86 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PBRM1Q86U86 LYPLA2P1-203ENST00000447689 696 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PBRM1Q86U86 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PBRM1Q86U86 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PBRM1Q86U86 CYB561D1-207ENST00000527072 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PBRM1Q86U86 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PBRM1Q86U86 AC009145.4-201ENST00000625119 1294 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PBRM1Q86U86 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PBRM1Q86U86 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
PBRM1Q86U86 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PBRM1Q86U86 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PBRM1Q86U86 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PBRM1Q86U86 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PBRM1Q86U86 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PBRM1Q86U86 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PBRM1Q86U86 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PBRM1Q86U86 MAGOH-202ENST00000371470 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PBRM1Q86U86 AC004973.1-201ENST00000413240 635 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PBRM1Q86U86 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PBRM1Q86U86 NUDT4P2-201ENST00000578341 546 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PBRM1Q86U86 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PBRM1Q86U86 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PBRM1Q86U86 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PBRM1Q86U86 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PBRM1Q86U86 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PBRM1Q86U86 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PBRM1Q86U86 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PBRM1Q86U86 FAM69C-202ENST00000400291 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PBRM1Q86U86 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PBRM1Q86U86 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PBRM1Q86U86 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PBRM1Q86U86 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PBRM1Q86U86 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PBRM1Q86U86 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PBRM1Q86U86 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PBRM1Q86U86 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PBRM1Q86U86 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PBRM1Q86U86 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PBRM1Q86U86 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PBRM1Q86U86 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PBRM1Q86U86 Metazoa_SRP.100-201ENST00000447610 282 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PBRM1Q86U86 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PBRM1Q86U86 FRMD4A-208ENST00000493380 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PBRM1Q86U86 REEP5-205ENST00000504247 480 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PBRM1Q86U86 REEP5-207ENST00000513339 1139 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PBRM1Q86U86 NEU3-207ENST00000534628 746 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PBRM1Q86U86 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PBRM1Q86U86 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PBRM1Q86U86 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PBRM1Q86U86 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PBRM1Q86U86 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PBRM1Q86U86 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PBRM1Q86U86 CHCHD7-202ENST00000355315 1535 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PBRM1Q86U86 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PBRM1Q86U86 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PBRM1Q86U86 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PBRM1Q86U86 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PBRM1Q86U86 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PBRM1Q86U86 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PBRM1Q86U86 MPC1L-201ENST00000423387 571 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PBRM1Q86U86 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PBRM1Q86U86 AC009119.2-201ENST00000561562 723 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PBRM1Q86U86 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PBRM1Q86U86 GLUD1P2-203ENST00000631118 486 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PBRM1Q86U86 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PBRM1Q86U86 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PBRM1Q86U86 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PBRM1Q86U86 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PBRM1Q86U86 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PBRM1Q86U86 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PBRM1Q86U86 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PBRM1Q86U86 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PBRM1Q86U86 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PBRM1Q86U86 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PBRM1Q86U86 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PBRM1Q86U86 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PBRM1Q86U86 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PBRM1Q86U86 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PBRM1Q86U86 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.6 ms