Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSS7

MFSD6, Major facilitator superfamily domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 791 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFSD6Q6ZSS7 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MFSD6Q6ZSS7 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MFSD6Q6ZSS7 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MFSD6Q6ZSS7 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MFSD6Q6ZSS7 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
MFSD6Q6ZSS7 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MFSD6Q6ZSS7 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MFSD6Q6ZSS7 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MFSD6Q6ZSS7 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MFSD6Q6ZSS7 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MFSD6Q6ZSS7 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
MFSD6Q6ZSS7 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MFSD6Q6ZSS7 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
MFSD6Q6ZSS7 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MFSD6Q6ZSS7 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MFSD6Q6ZSS7 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MFSD6Q6ZSS7 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
MFSD6Q6ZSS7 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MFSD6Q6ZSS7 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MFSD6Q6ZSS7 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MFSD6Q6ZSS7 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MFSD6Q6ZSS7 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MFSD6Q6ZSS7 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MFSD6Q6ZSS7 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MFSD6Q6ZSS7 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
MFSD6Q6ZSS7 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MFSD6Q6ZSS7 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MFSD6Q6ZSS7 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MFSD6Q6ZSS7 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MFSD6Q6ZSS7 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MFSD6Q6ZSS7 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MFSD6Q6ZSS7 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MFSD6Q6ZSS7 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MFSD6Q6ZSS7 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MFSD6Q6ZSS7 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MFSD6Q6ZSS7 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MFSD6Q6ZSS7 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MFSD6Q6ZSS7 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MFSD6Q6ZSS7 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MFSD6Q6ZSS7 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MFSD6Q6ZSS7 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MFSD6Q6ZSS7 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
MFSD6Q6ZSS7 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MFSD6Q6ZSS7 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MFSD6Q6ZSS7 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MFSD6Q6ZSS7 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MFSD6Q6ZSS7 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MFSD6Q6ZSS7 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
MFSD6Q6ZSS7 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MFSD6Q6ZSS7 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MFSD6Q6ZSS7 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MFSD6Q6ZSS7 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MFSD6Q6ZSS7 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MFSD6Q6ZSS7 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MFSD6Q6ZSS7 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MFSD6Q6ZSS7 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
MFSD6Q6ZSS7 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MFSD6Q6ZSS7 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MFSD6Q6ZSS7 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MFSD6Q6ZSS7 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MFSD6Q6ZSS7 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MFSD6Q6ZSS7 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MFSD6Q6ZSS7 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MFSD6Q6ZSS7 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MFSD6Q6ZSS7 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MFSD6Q6ZSS7 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MFSD6Q6ZSS7 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MFSD6Q6ZSS7 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
MFSD6Q6ZSS7 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
MFSD6Q6ZSS7 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MFSD6Q6ZSS7 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MFSD6Q6ZSS7 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
MFSD6Q6ZSS7 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MFSD6Q6ZSS7 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MFSD6Q6ZSS7 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MFSD6Q6ZSS7 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MFSD6Q6ZSS7 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MFSD6Q6ZSS7 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MFSD6Q6ZSS7 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MFSD6Q6ZSS7 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
MFSD6Q6ZSS7 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MFSD6Q6ZSS7 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MFSD6Q6ZSS7 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MFSD6Q6ZSS7 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MFSD6Q6ZSS7 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MFSD6Q6ZSS7 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MFSD6Q6ZSS7 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MFSD6Q6ZSS7 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MFSD6Q6ZSS7 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MFSD6Q6ZSS7 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MFSD6Q6ZSS7 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MFSD6Q6ZSS7 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MFSD6Q6ZSS7 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MFSD6Q6ZSS7 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MFSD6Q6ZSS7 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
MFSD6Q6ZSS7 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MFSD6Q6ZSS7 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MFSD6Q6ZSS7 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MFSD6Q6ZSS7 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MFSD6Q6ZSS7 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms