Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZP82

CCDC141, Coiled-coil domain-containing protein 141, humanhuman

Predictions only

Length 1,450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC141Q6ZP82 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC141Q6ZP82 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC141Q6ZP82 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC141Q6ZP82 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC141Q6ZP82 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC141Q6ZP82 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC141Q6ZP82 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC141Q6ZP82 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC141Q6ZP82 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC141Q6ZP82 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC141Q6ZP82 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC141Q6ZP82 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC141Q6ZP82 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC141Q6ZP82 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC141Q6ZP82 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC141Q6ZP82 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC141Q6ZP82 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC141Q6ZP82 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC141Q6ZP82 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC141Q6ZP82 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC141Q6ZP82 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC141Q6ZP82 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC141Q6ZP82 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC141Q6ZP82 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC141Q6ZP82 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC141Q6ZP82 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CCDC141Q6ZP82 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC141Q6ZP82 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC141Q6ZP82 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC141Q6ZP82 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC141Q6ZP82 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC141Q6ZP82 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC141Q6ZP82 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC141Q6ZP82 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC141Q6ZP82 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC141Q6ZP82 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC141Q6ZP82 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC141Q6ZP82 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC141Q6ZP82 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC141Q6ZP82 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC141Q6ZP82 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC141Q6ZP82 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC141Q6ZP82 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC141Q6ZP82 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC141Q6ZP82 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC141Q6ZP82 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC141Q6ZP82 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC141Q6ZP82 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC141Q6ZP82 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC141Q6ZP82 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC141Q6ZP82 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC141Q6ZP82 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC141Q6ZP82 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC141Q6ZP82 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC141Q6ZP82 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC141Q6ZP82 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC141Q6ZP82 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC141Q6ZP82 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC141Q6ZP82 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC141Q6ZP82 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC141Q6ZP82 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC141Q6ZP82 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC141Q6ZP82 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC141Q6ZP82 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC141Q6ZP82 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC141Q6ZP82 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC141Q6ZP82 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC141Q6ZP82 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC141Q6ZP82 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC141Q6ZP82 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC141Q6ZP82 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC141Q6ZP82 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC141Q6ZP82 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC141Q6ZP82 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC141Q6ZP82 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC141Q6ZP82 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC141Q6ZP82 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC141Q6ZP82 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC141Q6ZP82 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC141Q6ZP82 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC141Q6ZP82 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC141Q6ZP82 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC141Q6ZP82 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC141Q6ZP82 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC141Q6ZP82 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC141Q6ZP82 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC141Q6ZP82 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC141Q6ZP82 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC141Q6ZP82 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC141Q6ZP82 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC141Q6ZP82 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC141Q6ZP82 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC141Q6ZP82 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC141Q6ZP82 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC141Q6ZP82 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC141Q6ZP82 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC141Q6ZP82 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC141Q6ZP82 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC141Q6ZP82 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC141Q6ZP82 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms