Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 1,325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ZBED9Q6R2W3 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ZBED9Q6R2W3 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZBED9Q6R2W3 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZBED9Q6R2W3 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZBED9Q6R2W3 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZBED9Q6R2W3 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZBED9Q6R2W3 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZBED9Q6R2W3 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ZBED9Q6R2W3 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ZBED9Q6R2W3 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ZBED9Q6R2W3 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZBED9Q6R2W3 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZBED9Q6R2W3 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZBED9Q6R2W3 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZBED9Q6R2W3 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZBED9Q6R2W3 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZBED9Q6R2W3 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZBED9Q6R2W3 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZBED9Q6R2W3 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ZBED9Q6R2W3 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZBED9Q6R2W3 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZBED9Q6R2W3 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZBED9Q6R2W3 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZBED9Q6R2W3 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZBED9Q6R2W3 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZBED9Q6R2W3 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZBED9Q6R2W3 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZBED9Q6R2W3 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZBED9Q6R2W3 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZBED9Q6R2W3 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZBED9Q6R2W3 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ZBED9Q6R2W3 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZBED9Q6R2W3 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZBED9Q6R2W3 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZBED9Q6R2W3 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZBED9Q6R2W3 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZBED9Q6R2W3 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ZBED9Q6R2W3 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZBED9Q6R2W3 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZBED9Q6R2W3 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZBED9Q6R2W3 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ZBED9Q6R2W3 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZBED9Q6R2W3 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZBED9Q6R2W3 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZBED9Q6R2W3 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ZBED9Q6R2W3 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ZBED9Q6R2W3 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ZBED9Q6R2W3 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZBED9Q6R2W3 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZBED9Q6R2W3 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZBED9Q6R2W3 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZBED9Q6R2W3 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
ZBED9Q6R2W3 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
ZBED9Q6R2W3 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZBED9Q6R2W3 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZBED9Q6R2W3 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ZBED9Q6R2W3 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZBED9Q6R2W3 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZBED9Q6R2W3 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZBED9Q6R2W3 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZBED9Q6R2W3 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZBED9Q6R2W3 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZBED9Q6R2W3 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZBED9Q6R2W3 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZBED9Q6R2W3 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZBED9Q6R2W3 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZBED9Q6R2W3 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZBED9Q6R2W3 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ZBED9Q6R2W3 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZBED9Q6R2W3 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZBED9Q6R2W3 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZBED9Q6R2W3 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZBED9Q6R2W3 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ZBED9Q6R2W3 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZBED9Q6R2W3 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZBED9Q6R2W3 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZBED9Q6R2W3 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ZBED9Q6R2W3 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ZBED9Q6R2W3 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZBED9Q6R2W3 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZBED9Q6R2W3 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZBED9Q6R2W3 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZBED9Q6R2W3 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZBED9Q6R2W3 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZBED9Q6R2W3 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZBED9Q6R2W3 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZBED9Q6R2W3 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZBED9Q6R2W3 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZBED9Q6R2W3 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZBED9Q6R2W3 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZBED9Q6R2W3 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZBED9Q6R2W3 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZBED9Q6R2W3 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZBED9Q6R2W3 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZBED9Q6R2W3 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZBED9Q6R2W3 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZBED9Q6R2W3 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
ZBED9Q6R2W3 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZBED9Q6R2W3 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
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