Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1Q0

LETMD1, LETM1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETMD1Q6P1Q0 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC15.07■□□□□ 0
LETMD1Q6P1Q0 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LETMD1Q6P1Q0 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC15.07■□□□□ 0
LETMD1Q6P1Q0 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC15.07■□□□□ 0
LETMD1Q6P1Q0 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC15.07■□□□□ 0
LETMD1Q6P1Q0 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LETMD1Q6P1Q0 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LETMD1Q6P1Q0 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LETMD1Q6P1Q0 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LETMD1Q6P1Q0 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LETMD1Q6P1Q0 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC15.07■□□□□ 0
LETMD1Q6P1Q0 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LETMD1Q6P1Q0 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LETMD1Q6P1Q0 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LETMD1Q6P1Q0 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LETMD1Q6P1Q0 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LETMD1Q6P1Q0 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LETMD1Q6P1Q0 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LETMD1Q6P1Q0 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LETMD1Q6P1Q0 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LETMD1Q6P1Q0 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LETMD1Q6P1Q0 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LETMD1Q6P1Q0 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LETMD1Q6P1Q0 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LETMD1Q6P1Q0 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LETMD1Q6P1Q0 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LETMD1Q6P1Q0 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LETMD1Q6P1Q0 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LETMD1Q6P1Q0 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LETMD1Q6P1Q0 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LETMD1Q6P1Q0 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LETMD1Q6P1Q0 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LETMD1Q6P1Q0 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LETMD1Q6P1Q0 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LETMD1Q6P1Q0 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LETMD1Q6P1Q0 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LETMD1Q6P1Q0 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LETMD1Q6P1Q0 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LETMD1Q6P1Q0 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC15.06■□□□□ 0
LETMD1Q6P1Q0 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
LETMD1Q6P1Q0 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
LETMD1Q6P1Q0 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC15.06■□□□□ 0
LETMD1Q6P1Q0 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LETMD1Q6P1Q0 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LETMD1Q6P1Q0 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LETMD1Q6P1Q0 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LETMD1Q6P1Q0 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC15.06■□□□□ 0
LETMD1Q6P1Q0 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LETMD1Q6P1Q0 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LETMD1Q6P1Q0 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LETMD1Q6P1Q0 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LETMD1Q6P1Q0 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
LETMD1Q6P1Q0 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.06■□□□□ 0
LETMD1Q6P1Q0 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LETMD1Q6P1Q0 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LETMD1Q6P1Q0 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LETMD1Q6P1Q0 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LETMD1Q6P1Q0 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LETMD1Q6P1Q0 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LETMD1Q6P1Q0 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LETMD1Q6P1Q0 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LETMD1Q6P1Q0 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LETMD1Q6P1Q0 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LETMD1Q6P1Q0 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LETMD1Q6P1Q0 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LETMD1Q6P1Q0 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LETMD1Q6P1Q0 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LETMD1Q6P1Q0 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
LETMD1Q6P1Q0 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LETMD1Q6P1Q0 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LETMD1Q6P1Q0 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
LETMD1Q6P1Q0 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
LETMD1Q6P1Q0 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LETMD1Q6P1Q0 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LETMD1Q6P1Q0 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
LETMD1Q6P1Q0 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
LETMD1Q6P1Q0 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LETMD1Q6P1Q0 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LETMD1Q6P1Q0 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LETMD1Q6P1Q0 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC15.05■□□□□ -0
LETMD1Q6P1Q0 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC15.05■□□□□ -0
LETMD1Q6P1Q0 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.05■□□□□ -0
LETMD1Q6P1Q0 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LETMD1Q6P1Q0 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LETMD1Q6P1Q0 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LETMD1Q6P1Q0 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LETMD1Q6P1Q0 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC15.05■□□□□ -0
LETMD1Q6P1Q0 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LETMD1Q6P1Q0 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LETMD1Q6P1Q0 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
LETMD1Q6P1Q0 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LETMD1Q6P1Q0 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC15.05■□□□□ -0
LETMD1Q6P1Q0 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LETMD1Q6P1Q0 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LETMD1Q6P1Q0 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LETMD1Q6P1Q0 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LETMD1Q6P1Q0 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LETMD1Q6P1Q0 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LETMD1Q6P1Q0 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LETMD1Q6P1Q0 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.6 ms