Protein–RNA interactions for Protein: Q6KB66

KRT80, Keratin, type II cytoskeletal 80, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT80Q6KB66 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
KRT80Q6KB66 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
KRT80Q6KB66 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
KRT80Q6KB66 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
KRT80Q6KB66 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
KRT80Q6KB66 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
KRT80Q6KB66 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
KRT80Q6KB66 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
KRT80Q6KB66 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
KRT80Q6KB66 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
KRT80Q6KB66 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
KRT80Q6KB66 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
KRT80Q6KB66 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
KRT80Q6KB66 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
KRT80Q6KB66 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
KRT80Q6KB66 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
KRT80Q6KB66 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
KRT80Q6KB66 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
KRT80Q6KB66 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
KRT80Q6KB66 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
KRT80Q6KB66 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
KRT80Q6KB66 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
KRT80Q6KB66 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
KRT80Q6KB66 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
KRT80Q6KB66 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
KRT80Q6KB66 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
KRT80Q6KB66 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
KRT80Q6KB66 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
KRT80Q6KB66 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
KRT80Q6KB66 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
KRT80Q6KB66 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
KRT80Q6KB66 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
KRT80Q6KB66 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
KRT80Q6KB66 NRXN1-222ENST00000625672 8113 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
KRT80Q6KB66 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
KRT80Q6KB66 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
KRT80Q6KB66 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
KRT80Q6KB66 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
KRT80Q6KB66 RPS6KC1-208ENST00000614059 4188 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
KRT80Q6KB66 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
KRT80Q6KB66 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
KRT80Q6KB66 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
KRT80Q6KB66 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
KRT80Q6KB66 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
KRT80Q6KB66 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
KRT80Q6KB66 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
KRT80Q6KB66 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
KRT80Q6KB66 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
KRT80Q6KB66 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
KRT80Q6KB66 GMPPB-203ENST00000480687 6108 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
KRT80Q6KB66 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
KRT80Q6KB66 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
KRT80Q6KB66 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
KRT80Q6KB66 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
KRT80Q6KB66 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
KRT80Q6KB66 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
KRT80Q6KB66 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
KRT80Q6KB66 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
KRT80Q6KB66 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
KRT80Q6KB66 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
KRT80Q6KB66 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
KRT80Q6KB66 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
KRT80Q6KB66 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
KRT80Q6KB66 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
KRT80Q6KB66 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
KRT80Q6KB66 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
KRT80Q6KB66 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
KRT80Q6KB66 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
KRT80Q6KB66 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
KRT80Q6KB66 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
KRT80Q6KB66 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
KRT80Q6KB66 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
KRT80Q6KB66 DDX31-204ENST00000372159 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
KRT80Q6KB66 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
KRT80Q6KB66 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
KRT80Q6KB66 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
KRT80Q6KB66 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
KRT80Q6KB66 DDX3X-201ENST00000399959 5399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
KRT80Q6KB66 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
KRT80Q6KB66 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
KRT80Q6KB66 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
KRT80Q6KB66 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
KRT80Q6KB66 YIPF6-204ENST00000462683 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
KRT80Q6KB66 CFAP46-202ENST00000368586 8278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
KRT80Q6KB66 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
KRT80Q6KB66 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
KRT80Q6KB66 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
KRT80Q6KB66 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
KRT80Q6KB66 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
KRT80Q6KB66 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
KRT80Q6KB66 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
KRT80Q6KB66 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
KRT80Q6KB66 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
KRT80Q6KB66 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
KRT80Q6KB66 NUDT3-201ENST00000607016 9905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
KRT80Q6KB66 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
KRT80Q6KB66 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
KRT80Q6KB66 CPSF1-212ENST00000616140 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
KRT80Q6KB66 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
KRT80Q6KB66 HCFC2-201ENST00000229330 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms