Protein–RNA interactions for Protein: Q5SY13

COL5A1-AS1, Putative uncharacterized protein encoded by COL5A1-AS1, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL5A1-AS1Q5SY13 AGAP6-202ENST00000412531 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
COL5A1-AS1Q5SY13 PIWIL1-201ENST00000245255 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
COL5A1-AS1Q5SY13 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
COL5A1-AS1Q5SY13 TLE3-208ENST00000557907 2295 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
COL5A1-AS1Q5SY13 FAM122C-203ENST00000414371 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
COL5A1-AS1Q5SY13 SPTB-202ENST00000389720 6321 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
COL5A1-AS1Q5SY13 SNX14-201ENST00000314673 3486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
COL5A1-AS1Q5SY13 AL445209.1-201ENST00000607269 3491 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
COL5A1-AS1Q5SY13 SLC25A25-203ENST00000373068 3431 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
COL5A1-AS1Q5SY13 AC073335.2-201ENST00000610177 3441 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
COL5A1-AS1Q5SY13 PCSK2-202ENST00000377899 4674 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
COL5A1-AS1Q5SY13 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
COL5A1-AS1Q5SY13 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
COL5A1-AS1Q5SY13 WIPI1-201ENST00000262139 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
COL5A1-AS1Q5SY13 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
COL5A1-AS1Q5SY13 CELF1-204ENST00000395290 7666 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
COL5A1-AS1Q5SY13 LRCH1-203ENST00000389798 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
COL5A1-AS1Q5SY13 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
COL5A1-AS1Q5SY13 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
COL5A1-AS1Q5SY13 LINC00477-201ENST00000483544 1710 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
COL5A1-AS1Q5SY13 LRRN2-201ENST00000367175 5036 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
COL5A1-AS1Q5SY13 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
COL5A1-AS1Q5SY13 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
COL5A1-AS1Q5SY13 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
COL5A1-AS1Q5SY13 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
COL5A1-AS1Q5SY13 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
COL5A1-AS1Q5SY13 ATXN2L-201ENST00000325215 3788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
COL5A1-AS1Q5SY13 CARS-AS1-201ENST00000499962 2664 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
COL5A1-AS1Q5SY13 NPR2-201ENST00000342694 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
COL5A1-AS1Q5SY13 TNRC18P1-201ENST00000502875 3650 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
COL5A1-AS1Q5SY13 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
COL5A1-AS1Q5SY13 RPP30-202ENST00000371703 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
COL5A1-AS1Q5SY13 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
COL5A1-AS1Q5SY13 LINC00638-201ENST00000555578 2518 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
COL5A1-AS1Q5SY13 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
COL5A1-AS1Q5SY13 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
COL5A1-AS1Q5SY13 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
COL5A1-AS1Q5SY13 SLC25A25-204ENST00000373069 3376 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
COL5A1-AS1Q5SY13 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
COL5A1-AS1Q5SY13 SLC7A7-201ENST00000285850 2263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
COL5A1-AS1Q5SY13 RXRG-204ENST00000619224 2252 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
COL5A1-AS1Q5SY13 ST3GAL5-204ENST00000393808 2236 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
COL5A1-AS1Q5SY13 MYO9B-201ENST00000397274 7532 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
COL5A1-AS1Q5SY13 GPD1-201ENST00000301149 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
COL5A1-AS1Q5SY13 ADAM8-201ENST00000415217 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
COL5A1-AS1Q5SY13 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
COL5A1-AS1Q5SY13 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
COL5A1-AS1Q5SY13 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
COL5A1-AS1Q5SY13 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
COL5A1-AS1Q5SY13 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
COL5A1-AS1Q5SY13 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
COL5A1-AS1Q5SY13 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
COL5A1-AS1Q5SY13 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
COL5A1-AS1Q5SY13 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
COL5A1-AS1Q5SY13 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC10.95□□□□□ -0.66
COL5A1-AS1Q5SY13 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
COL5A1-AS1Q5SY13 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
COL5A1-AS1Q5SY13 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
COL5A1-AS1Q5SY13 TUBB8P7-202ENST00000564451 2115 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
COL5A1-AS1Q5SY13 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
COL5A1-AS1Q5SY13 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
COL5A1-AS1Q5SY13 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
COL5A1-AS1Q5SY13 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
COL5A1-AS1Q5SY13 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
COL5A1-AS1Q5SY13 ADARB1-214ENST00000629643 4583 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
COL5A1-AS1Q5SY13 ASAH2B-202ENST00000374007 3715 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
COL5A1-AS1Q5SY13 TCOF1-207ENST00000504761 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
COL5A1-AS1Q5SY13 POU5F2-201ENST00000606183 8418 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
COL5A1-AS1Q5SY13 ZNF202-207ENST00000530393 3564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
COL5A1-AS1Q5SY13 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
COL5A1-AS1Q5SY13 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
COL5A1-AS1Q5SY13 CPLX4-202ENST00000587244 1916 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
COL5A1-AS1Q5SY13 DEK-202ENST00000397239 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
COL5A1-AS1Q5SY13 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
COL5A1-AS1Q5SY13 OSTM1-AS1-202ENST00000441184 3334 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
COL5A1-AS1Q5SY13 KLHL13-209ENST00000545703 3322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
COL5A1-AS1Q5SY13 POPDC2-208ENST00000493094 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
COL5A1-AS1Q5SY13 UBE2I-202ENST00000355803 3253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
COL5A1-AS1Q5SY13 PLEC-208ENST00000436759 14787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
COL5A1-AS1Q5SY13 MAP7D2-201ENST00000379643 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
COL5A1-AS1Q5SY13 SIN3A-202ENST00000394947 6737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
COL5A1-AS1Q5SY13 RFX5-202ENST00000368870 2459 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
COL5A1-AS1Q5SY13 LINC01623-201ENST00000440244 2458 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
COL5A1-AS1Q5SY13 FAM237B-201ENST00000637645 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
COL5A1-AS1Q5SY13 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
COL5A1-AS1Q5SY13 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
COL5A1-AS1Q5SY13 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC10.95□□□□□ -0.66
COL5A1-AS1Q5SY13 SHANK2-203ENST00000409161 9208 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
COL5A1-AS1Q5SY13 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
COL5A1-AS1Q5SY13 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
COL5A1-AS1Q5SY13 FLNA-204ENST00000369856 8241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
COL5A1-AS1Q5SY13 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
COL5A1-AS1Q5SY13 CSPG4P13-202ENST00000567704 4801 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
COL5A1-AS1Q5SY13 MYO1D-206ENST00000579584 3500 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
COL5A1-AS1Q5SY13 LOXL3-204ENST00000409549 2897 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
COL5A1-AS1Q5SY13 SH3PXD2B-201ENST00000311601 7777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
COL5A1-AS1Q5SY13 CLCN4-203ENST00000421085 6534 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
COL5A1-AS1Q5SY13 ALDH1L1-202ENST00000393431 2797 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
COL5A1-AS1Q5SY13 DPY19L2P2-205ENST00000439473 3994 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
COL5A1-AS1Q5SY13 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms