Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC11.25□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 SCNN1A-215ENST00000540037 3040 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 SYBU-217ENST00000528331 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 NOS3-203ENST00000461406 3644 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 SLC27A6-203ENST00000506176 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 ADAM11-201ENST00000200557 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 SLC25A25-205ENST00000432073 3678 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 ZBED2-201ENST00000317012 2311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 ARL13B-201ENST00000303097 3264 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 SMAP1-203ENST00000370455 3333 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 SNAP91-215ENST00000521743 4263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 PCDHGB8P-202ENST00000507007 2873 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 REXO5-208ENST00000564274 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 TRHDE-AS1-202ENST00000435350 2966 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 ANGPTL2-201ENST00000373417 2575 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 TK2-206ENST00000527800 2687 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 CAV1-209ENST00000614113 3201 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 C1S-221ENST00000617865 2844 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 NF1-204ENST00000431387 2889 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 BCRP2-203ENST00000461808 1832 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC11.24□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 COA4-204ENST00000541455 1038 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 AL031670.1-201ENST00000619343 669 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 DLGAP3-202ENST00000373347 3856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 PTH2R-201ENST00000272847 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 ATP2C1-221ENST00000513801 3439 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 RPS24-204ENST00000440692 2814 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.2 ms