Protein–RNA interactions for Protein: Q3LHN1

KRTAP21-3, Keratin-associated protein 21-3, humanhuman

Predictions only

Length 58 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-3Q3LHN1 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 GRP-201ENST00000256857 848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 SGCA-202ENST00000344627 1057 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 LEMD1-205ENST00000367154 786 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 LSM2-208ENST00000375661 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 WASIR1-201ENST00000399966 1054 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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KRTAP21-3Q3LHN1 AC007391.1-201ENST00000433893 504 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 DUX4L31-201ENST00000446466 1136 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
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KRTAP21-3Q3LHN1 TMEM14B-215ENST00000481240 1032 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 AL358215.1-201ENST00000481350 482 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 C21orf62-204ENST00000490358 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 AC145422.1-201ENST00000541574 544 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 BCAR1P1-201ENST00000553953 636 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 LOXL1-AS1-207ENST00000565689 735 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 AL031705.1-201ENST00000566922 682 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 AC032044.1-201ENST00000570924 570 ntTSL 4 BASIC11.49□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 RN7SL605P-201ENST00000577229 281 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 PSME3-213ENST00000592169 826 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
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KRTAP21-3Q3LHN1 LINC01869-204ENST00000635639 1047 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 AC137936.2-202ENST00000638124 1146 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 MECP2-226ENST00000640414 897 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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KRTAP21-3Q3LHN1 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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KRTAP21-3Q3LHN1 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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KRTAP21-3Q3LHN1 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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KRTAP21-3Q3LHN1 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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KRTAP21-3Q3LHN1 CELA3A-201ENST00000290122 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 MRPL55-209ENST00000366735 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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KRTAP21-3Q3LHN1 TCEAL4-206ENST00000468024 1135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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KRTAP21-3Q3LHN1 CDC37P2-201ENST00000562287 1029 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 AC104961.2-201ENST00000578129 663 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 IRF3-213ENST00000596765 710 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 UBA52-213ENST00000599551 707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 GPR45-201ENST00000258456 1307 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 GAPDH-205ENST00000396861 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 FXYD3-208ENST00000604404 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 OXSM-201ENST00000280701 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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