Protein–RNA interactions for Protein: Q32P28

P3H1, Prolyl 3-hydroxylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P3H1Q32P28 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P3H1Q32P28 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P3H1Q32P28 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P3H1Q32P28 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P3H1Q32P28 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
P3H1Q32P28 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P3H1Q32P28 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P3H1Q32P28 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P3H1Q32P28 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P3H1Q32P28 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P3H1Q32P28 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P3H1Q32P28 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P3H1Q32P28 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P3H1Q32P28 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P3H1Q32P28 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P3H1Q32P28 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P3H1Q32P28 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P3H1Q32P28 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P3H1Q32P28 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P3H1Q32P28 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P3H1Q32P28 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P3H1Q32P28 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P3H1Q32P28 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P3H1Q32P28 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P3H1Q32P28 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P3H1Q32P28 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P3H1Q32P28 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P3H1Q32P28 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P3H1Q32P28 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P3H1Q32P28 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P3H1Q32P28 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
P3H1Q32P28 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P3H1Q32P28 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P3H1Q32P28 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
P3H1Q32P28 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P3H1Q32P28 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P3H1Q32P28 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P3H1Q32P28 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P3H1Q32P28 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P3H1Q32P28 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P3H1Q32P28 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P3H1Q32P28 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P3H1Q32P28 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P3H1Q32P28 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P3H1Q32P28 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P3H1Q32P28 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P3H1Q32P28 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P3H1Q32P28 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P3H1Q32P28 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
P3H1Q32P28 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P3H1Q32P28 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P3H1Q32P28 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P3H1Q32P28 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P3H1Q32P28 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P3H1Q32P28 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P3H1Q32P28 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P3H1Q32P28 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P3H1Q32P28 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P3H1Q32P28 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P3H1Q32P28 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P3H1Q32P28 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
P3H1Q32P28 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P3H1Q32P28 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P3H1Q32P28 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P3H1Q32P28 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P3H1Q32P28 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P3H1Q32P28 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P3H1Q32P28 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P3H1Q32P28 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P3H1Q32P28 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P3H1Q32P28 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P3H1Q32P28 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P3H1Q32P28 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P3H1Q32P28 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P3H1Q32P28 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P3H1Q32P28 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P3H1Q32P28 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P3H1Q32P28 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P3H1Q32P28 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
P3H1Q32P28 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P3H1Q32P28 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P3H1Q32P28 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P3H1Q32P28 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P3H1Q32P28 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P3H1Q32P28 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P3H1Q32P28 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
P3H1Q32P28 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
P3H1Q32P28 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P3H1Q32P28 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P3H1Q32P28 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P3H1Q32P28 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P3H1Q32P28 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P3H1Q32P28 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P3H1Q32P28 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P3H1Q32P28 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P3H1Q32P28 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P3H1Q32P28 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P3H1Q32P28 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P3H1Q32P28 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P3H1Q32P28 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms