Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBA0

KLHL40, Kelch-like protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL40Q2TBA0 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms