Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKQ1

SGSM1, Small G protein signaling modulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM1Q2NKQ1 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SGSM1Q2NKQ1 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SGSM1Q2NKQ1 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SGSM1Q2NKQ1 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SGSM1Q2NKQ1 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SGSM1Q2NKQ1 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SGSM1Q2NKQ1 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SGSM1Q2NKQ1 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SGSM1Q2NKQ1 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SGSM1Q2NKQ1 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SGSM1Q2NKQ1 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SGSM1Q2NKQ1 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SGSM1Q2NKQ1 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SGSM1Q2NKQ1 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SGSM1Q2NKQ1 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SGSM1Q2NKQ1 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SGSM1Q2NKQ1 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SGSM1Q2NKQ1 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SGSM1Q2NKQ1 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SGSM1Q2NKQ1 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SGSM1Q2NKQ1 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SGSM1Q2NKQ1 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SGSM1Q2NKQ1 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SGSM1Q2NKQ1 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SGSM1Q2NKQ1 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SGSM1Q2NKQ1 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SGSM1Q2NKQ1 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SGSM1Q2NKQ1 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SGSM1Q2NKQ1 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SGSM1Q2NKQ1 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SGSM1Q2NKQ1 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SGSM1Q2NKQ1 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SGSM1Q2NKQ1 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SGSM1Q2NKQ1 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SGSM1Q2NKQ1 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SGSM1Q2NKQ1 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SGSM1Q2NKQ1 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SGSM1Q2NKQ1 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SGSM1Q2NKQ1 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SGSM1Q2NKQ1 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SGSM1Q2NKQ1 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SGSM1Q2NKQ1 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SGSM1Q2NKQ1 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SGSM1Q2NKQ1 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SGSM1Q2NKQ1 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SGSM1Q2NKQ1 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SGSM1Q2NKQ1 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SGSM1Q2NKQ1 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SGSM1Q2NKQ1 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SGSM1Q2NKQ1 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SGSM1Q2NKQ1 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SGSM1Q2NKQ1 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SGSM1Q2NKQ1 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SGSM1Q2NKQ1 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SGSM1Q2NKQ1 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SGSM1Q2NKQ1 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SGSM1Q2NKQ1 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SGSM1Q2NKQ1 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SGSM1Q2NKQ1 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SGSM1Q2NKQ1 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SGSM1Q2NKQ1 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SGSM1Q2NKQ1 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SGSM1Q2NKQ1 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SGSM1Q2NKQ1 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SGSM1Q2NKQ1 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SGSM1Q2NKQ1 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SGSM1Q2NKQ1 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SGSM1Q2NKQ1 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SGSM1Q2NKQ1 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SGSM1Q2NKQ1 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SGSM1Q2NKQ1 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SGSM1Q2NKQ1 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SGSM1Q2NKQ1 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SGSM1Q2NKQ1 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SGSM1Q2NKQ1 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SGSM1Q2NKQ1 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SGSM1Q2NKQ1 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SGSM1Q2NKQ1 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SGSM1Q2NKQ1 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SGSM1Q2NKQ1 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SGSM1Q2NKQ1 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SGSM1Q2NKQ1 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SGSM1Q2NKQ1 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SGSM1Q2NKQ1 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SGSM1Q2NKQ1 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SGSM1Q2NKQ1 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SGSM1Q2NKQ1 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SGSM1Q2NKQ1 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SGSM1Q2NKQ1 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SGSM1Q2NKQ1 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SGSM1Q2NKQ1 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SGSM1Q2NKQ1 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SGSM1Q2NKQ1 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SGSM1Q2NKQ1 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SGSM1Q2NKQ1 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SGSM1Q2NKQ1 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SGSM1Q2NKQ1 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SGSM1Q2NKQ1 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SGSM1Q2NKQ1 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SGSM1Q2NKQ1 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
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