Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

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Length 1,714 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
COL24A1Q17RW2 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
COL24A1Q17RW2 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
COL24A1Q17RW2 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
COL24A1Q17RW2 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
COL24A1Q17RW2 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
COL24A1Q17RW2 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
COL24A1Q17RW2 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
COL24A1Q17RW2 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
COL24A1Q17RW2 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
COL24A1Q17RW2 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
COL24A1Q17RW2 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
COL24A1Q17RW2 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
COL24A1Q17RW2 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
COL24A1Q17RW2 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
COL24A1Q17RW2 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
COL24A1Q17RW2 FHL2-206ENST00000408995 1367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
COL24A1Q17RW2 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
COL24A1Q17RW2 AL020996.1-201ENST00000442055 435 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
COL24A1Q17RW2 CYB561D1-207ENST00000527072 892 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
COL24A1Q17RW2 ZSCAN10-205ENST00000572548 618 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
COL24A1Q17RW2 AP001527.2-201ENST00000614441 631 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
COL24A1Q17RW2 AC073911.3-201ENST00000624401 631 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
COL24A1Q17RW2 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
COL24A1Q17RW2 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
COL24A1Q17RW2 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
COL24A1Q17RW2 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
COL24A1Q17RW2 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
COL24A1Q17RW2 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
COL24A1Q17RW2 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
COL24A1Q17RW2 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
COL24A1Q17RW2 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
COL24A1Q17RW2 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
COL24A1Q17RW2 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
COL24A1Q17RW2 AC090502.4-201ENST00000551714 1386 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
COL24A1Q17RW2 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
COL24A1Q17RW2 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
COL24A1Q17RW2 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
COL24A1Q17RW2 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
COL24A1Q17RW2 AC148477.9-201ENST00000623974 539 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
COL24A1Q17RW2 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
COL24A1Q17RW2 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
COL24A1Q17RW2 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
COL24A1Q17RW2 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
COL24A1Q17RW2 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
COL24A1Q17RW2 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
COL24A1Q17RW2 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
COL24A1Q17RW2 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
COL24A1Q17RW2 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
COL24A1Q17RW2 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
COL24A1Q17RW2 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
COL24A1Q17RW2 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
COL24A1Q17RW2 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
COL24A1Q17RW2 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
COL24A1Q17RW2 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
COL24A1Q17RW2 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
COL24A1Q17RW2 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
COL24A1Q17RW2 LYPLA2P1-203ENST00000447689 696 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
COL24A1Q17RW2 AC018463.1-201ENST00000456674 917 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
COL24A1Q17RW2 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.63
COL24A1Q17RW2 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
COL24A1Q17RW2 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
COL24A1Q17RW2 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
COL24A1Q17RW2 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
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COL24A1Q17RW2 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
COL24A1Q17RW2 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
COL24A1Q17RW2 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
COL24A1Q17RW2 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
COL24A1Q17RW2 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
COL24A1Q17RW2 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
COL24A1Q17RW2 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
COL24A1Q17RW2 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
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COL24A1Q17RW2 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
COL24A1Q17RW2 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
COL24A1Q17RW2 PIGL-201ENST00000225609 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
COL24A1Q17RW2 HBB-201ENST00000335295 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
COL24A1Q17RW2 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
COL24A1Q17RW2 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
COL24A1Q17RW2 SUMF2-210ENST00000437307 947 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
COL24A1Q17RW2 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
COL24A1Q17RW2 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
COL24A1Q17RW2 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
COL24A1Q17RW2 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
COL24A1Q17RW2 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
COL24A1Q17RW2 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
COL24A1Q17RW2 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
COL24A1Q17RW2 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
COL24A1Q17RW2 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
COL24A1Q17RW2 MIR22HG-201ENST00000334146 1383 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
COL24A1Q17RW2 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
COL24A1Q17RW2 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
COL24A1Q17RW2 HFE-203ENST00000336625 804 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
COL24A1Q17RW2 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
COL24A1Q17RW2 DNAJB13-203ENST00000537753 912 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
COL24A1Q17RW2 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
COL24A1Q17RW2 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
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