Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CTF1Q16619 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CTF1Q16619 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CTF1Q16619 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CTF1Q16619 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CTF1Q16619 RRN3P3-202ENST00000551766 3366 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CTF1Q16619 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CTF1Q16619 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CTF1Q16619 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CTF1Q16619 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CTF1Q16619 SLC22A2-202ENST00000366953 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CTF1Q16619 SPOCK3-218ENST00000511531 2908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CTF1Q16619 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CTF1Q16619 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CTF1Q16619 ANKRD20A19P-202ENST00000442969 2796 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CTF1Q16619 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CTF1Q16619 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CTF1Q16619 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CTF1Q16619 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CTF1Q16619 C1QTNF1-204ENST00000392445 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CTF1Q16619 AC118758.2-201ENST00000614242 2813 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
CTF1Q16619 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CTF1Q16619 C19orf66-202ENST00000397881 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CTF1Q16619 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CTF1Q16619 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CTF1Q16619 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CTF1Q16619 ANO7-202ENST00000402430 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CTF1Q16619 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CTF1Q16619 NDRG4-255ENST00000570248 3207 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CTF1Q16619 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CTF1Q16619 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CTF1Q16619 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CTF1Q16619 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CTF1Q16619 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CTF1Q16619 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CTF1Q16619 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CTF1Q16619 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CTF1Q16619 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CTF1Q16619 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CTF1Q16619 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CTF1Q16619 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CTF1Q16619 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CTF1Q16619 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CTF1Q16619 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CTF1Q16619 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CTF1Q16619 FFAR4-202ENST00000371483 3653 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CTF1Q16619 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CTF1Q16619 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CTF1Q16619 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CTF1Q16619 PNRC2-201ENST00000334351 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CTF1Q16619 AC020658.7-201ENST00000624274 2442 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
CTF1Q16619 HOXA3-207ENST00000612286 3396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CTF1Q16619 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CTF1Q16619 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CTF1Q16619 SAFB-211ENST00000592224 3014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CTF1Q16619 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CTF1Q16619 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CTF1Q16619 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CTF1Q16619 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CTF1Q16619 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CTF1Q16619 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CTF1Q16619 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CTF1Q16619 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CTF1Q16619 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CTF1Q16619 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CTF1Q16619 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
CTF1Q16619 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
CTF1Q16619 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
CTF1Q16619 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
CTF1Q16619 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
CTF1Q16619 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
CTF1Q16619 NFATC2-203ENST00000414705 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
CTF1Q16619 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
CTF1Q16619 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CTF1Q16619 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CTF1Q16619 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CTF1Q16619 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CTF1Q16619 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CTF1Q16619 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CTF1Q16619 RHOH-224ENST00000622175 2254 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CTF1Q16619 PELP1-202ENST00000436683 3524 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CTF1Q16619 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CTF1Q16619 DPP8-202ENST00000321147 3125 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CTF1Q16619 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CTF1Q16619 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CTF1Q16619 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CTF1Q16619 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CTF1Q16619 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CTF1Q16619 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CTF1Q16619 FAAP100-202ENST00000425898 2996 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CTF1Q16619 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CTF1Q16619 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
CTF1Q16619 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
CTF1Q16619 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CTF1Q16619 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
CTF1Q16619 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CTF1Q16619 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CTF1Q16619 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CTF1Q16619 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CTF1Q16619 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms