Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SGCAQ16586 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
SGCAQ16586 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SGCAQ16586 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SGCAQ16586 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SGCAQ16586 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SGCAQ16586 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SGCAQ16586 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SGCAQ16586 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
SGCAQ16586 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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SGCAQ16586 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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SGCAQ16586 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
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SGCAQ16586 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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SGCAQ16586 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SGCAQ16586 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SGCAQ16586 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
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SGCAQ16586 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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SGCAQ16586 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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SGCAQ16586 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
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SGCAQ16586 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
SGCAQ16586 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
SGCAQ16586 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
SGCAQ16586 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.18
SGCAQ16586 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
SGCAQ16586 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
SGCAQ16586 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
SGCAQ16586 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SGCAQ16586 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SGCAQ16586 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SGCAQ16586 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SGCAQ16586 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SGCAQ16586 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SGCAQ16586 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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